在文件夹上使用awk并将文件名添加到输出行

首先，我要感谢大家为本网站的答案所做的一切工作。我花了很多时间通读它们，但还没有找到任何适合我的问题。因此我有自己的职位

我有一个文件夹，其中包含多个子文件夹和txt文件。在这些文件的第7列中，有一些基因名称（我以遗传学为生：））。这些是我试图提取的字符串。很快，我想在整个文件夹中搜索包含特定基因名称/字符串的任何文件中的任何行。为此，我一直在使用grep，编写如下内容：

grep -r GENE . > GENE.txt

很简单，但我需要能够进一步调整搜索，看来awk是一个不错的选择

所以我试着用awk。我写了这样的东西：

awk '$7 == "GENENAME"' FOLDER/* > GENENAME.txt 

这很好（现在我可以指定字符串必须在特定列中，这是我不能用grep做的，对吗？）。 然而，与grep不同，grep将文件名写在每一行的开头，我现在无法直接看到输出文件中的哪一行来自哪个文件（这在很大程度上破坏了搜索的重点）。这样，在每一行的某处添加源文件的名称，似乎是绝对可行的，但我无法理解

我在其中搜索的文件会发生变化（或者更确切地说是数量更多），但如果不是这样，我将始终搜索同一个大文件夹第7列中的某个特定字符串。我怎样才能让它工作

提前谢谢大家,，

---

Elisabet E

您可以使用

FNR

（FNR表示记录的文件号）打印行号和

FILENAME

打印文件名，然后从哪个文件和哪个行获得匹配行，例如：

sample.csv：

aaa 123
bbb 456
aaa 789

命令：

awk '$1 =="aaa"{print $0, FNR, FILENAME}' sample.csv

输出为：

aaa 123 1 sample.csv
aaa 789 3 sample.csv

---

听起来你在寻找：

awk '$7 == "GENENAME"{print FILENAME, $0}' FOLDER/*

---

如果没有，则编辑您的问题，以通过示例输入和预期输出进行澄清。

将原始文件的名称添加到每行的某个位置-Unclarwell，如果您知道如何定义列，您可以使

grep

仅搜索特定列的模式，例如

seq 10 | tr'\n'.\grep-e'^（[^]+）{6}7'

@karakfa谢谢，忘了换了！这是一个输入错误，我的sample.csv中只有一列，我添加了数值列以使我的帖子更清晰