awk删除文本并在两个分隔符上拆分

我正在尝试使用

awk

删除最后一个数字后的文本，并按

：

分割。这对两行来说都是通用的，我相信下面的

awk

的第一部分可以做到这一点。如果行中没有

\uuu

，则

$2

会在

$3

中重复，我相信拆分可以做到这一点。我不知道怎么做，如果行中是

\uu

，则

\u

左侧的数字是

$2

，而

\u

右侧的数字是

$3

。谢谢：）

输入

chr7:140453136A>T 
chr7:140453135_140453136delCAinsTT

所需的

chr7    140453136   140453136 
chr7    140453135   140453136

awk

awk '{sub(/[^0-9]+$/, "", $1); {split($0,a,":"); print a[1],a[2]a[2]} 1' input

这里有一个：

$ awk '
BEGIN { 
    FS="[:_]"               # using field separation for the job
    OFS="\t"
}
{
    sub(/[^0-9]*$/,"",$NF)  # strip non-digits off the end of last field
    if(NF==2)               # if only 2 fields
        $3=$2               # make the $2 from $2
}1' file                    # output

输出：

chr7    140453136       140453136
chr7    140453135       140453136

在GNU awk、mawk、Busybox awk和awk版本20121220上测试。

以下是一个：

$ awk '
BEGIN { 
    FS="[:_]"               # using field separation for the job
    OFS="\t"
}
{
    sub(/[^0-9]*$/,"",$NF)  # strip non-digits off the end of last field
    if(NF==2)               # if only 2 fields
        $3=$2               # make the $2 from $2
}1' file                    # output

输出：

chr7    140453136       140453136
chr7    140453135       140453136

在GNU awk、mawk、Busybox awk和awk版本20121220上测试。

使用GNU awk：

awk -v FPAT='[0-9]+|chr[0-9]*' -v OFS='\t' 'NF==2{$3=$2}{$1=$1}1'

这取决于字段模式

FPAT

，它是一个表示数字的正则表达式或带有数字的字符串

chr

如果记录中只有2个字段，则语句

NF==2{$3=$2}

将复制第二个字段

最后一条语句是强制awk重新生成具有所需格式的记录。

使用GNU awk：

awk -v FPAT='[0-9]+|chr[0-9]*' -v OFS='\t' 'NF==2{$3=$2}{$1=$1}1'

这取决于字段模式

FPAT

，它是一个表示数字的正则表达式或带有数字的字符串

chr

如果记录中只有2个字段，则语句

NF==2{$3=$2}

将复制第二个字段

---

最后一条语句是强制awk重新生成记录，使其具有所需的格式。

请尝试以下更通用的解决方案，即无需硬编码将字段值复制到其他字段等，您只需在

awk

变量中提及字段值的最大数量，它将检查每一行（同时从其值中删除字母），并将最后一个值复制到该行的最大值末尾

awk -F'[:_]' -v max="3" '
{
  for(i=2;i<=max;i++){
    if($i==""){
      $i=$(i-1)
    }
    gsub(/[^0-9]+/,"",$i)
  }
}
1
'   Input_file

awk-F'[：]'-v max=“3”' {

---

对于（i=2；i您是否可以尝试以下更通用的解决方案，即无需硬编码将字段值复制到另一个字段等，您只需提及

awk

变量中字段值的最大数量，它将检查每一行（同时从其值中删除字母）并将最后一个值复制到该行的最大值末尾

awk -F'[:_]' -v max="3" '
{
  for(i=2;i<=max;i++){
    if($i==""){
      $i=$(i-1)
    }
    gsub(/[^0-9]+/,"",$i)
  }
}
1
'   Input_file

awk-F'[：]'-v max=“3”' {

---

对于（i=2；如果出现问题，请等待更长时间，您可能会得到一个bitchin'cool答案。相反，如果使用sub，您可以只执行

$NF+=0

。字符串到数字的转换规则将生效。当前版本将无法解决字符串1234gh5hsueNo问题，请等待更长时间，您可能会得到bitchin'cool答案。如果使用sub，您只需执行以下操作即可。）<代码>$NF+=0。字符串到数字的转换规则将生效。当前版本将在字符串1234gh5hsue上失败