Bash 无法识别存储在MAPFILE元素中的文件名的联接_Bash_Join

Bash 无法识别存储在MAPFILE元素中的文件名的联接

bash join

Bash 无法识别存储在MAPFILE元素中的文件名的联接,bash,join,Bash,Join,我试图通过共享查找列（第一列）连接65个文件。我正在命令行上测试部分代码，并且在作为JOIN输入的MAPFILE元素方面存在问题。我尝试了几种不同的方法来回显MAPFILE的元素，但都没有成功。当我用元素所代表的文件名替换元素时，它工作正常。如何将MAPFILE的元素传递给JOIN cat list.txt | ( mapfile -t; echo "${MAPFILE[@]}" ) | join -11 -21 -a1 -a2 -o1.1,1.2,2.2 -e0 ${MAPFILE[1]} $

我试图通过共享查找列（第一列）连接65个文件。我正在命令行上测试部分代码，并且在作为JOIN输入的MAPFILE元素方面存在问题。我尝试了几种不同的方法来回显MAPFILE的元素，但都没有成功。当我用元素所代表的文件名替换元素时，它工作正常。如何将MAPFILE的元素传递给JOIN

cat list.txt | ( mapfile -t; echo "${MAPFILE[@]}" ) | join -11 -21 -a1 -a2 -o1.1,1.2,2.2 -e0 ${MAPFILE[1]} ${MAPFILE[2]} >countmatrix.txt

尝试的其他战略：

cat list.txt | ( mapfile -t; echo "${MAPFILE[@]}" ) | (file1=$(echo ${MAPFILE[1]}); file2=$(echo ${MAPFILE[2]})) | join -1 -2 -a -o1.1,1.2,2.2 -e0 $file1 $file2 >countmatrix.txt

cat list.txt | ( mapfile -t; echo "${MAPFILE[@]}" ) | (file1=$(echo ${MAPFILE[1]}); file2=$(echo ${MAPFILE[2]}); join -11 -21 -a1 -a2 -o1.1,1.2,2.2 -e0 <(sort $file1) <(sort $file2) >countmatrix.txt)

cat list.txt |（mapfile-t；echo“${mapfile[@]}”）|（file1=$（echo${mapfile[1]}）；file2=$（echo${mapfile[2]}））| join-1-2-a-o1.1,1.2,2.2-e0$file1$file2>countmatrix.txt
cat list.txt |（mapfile-t；echo“${mapfile[@]}”）|（file1=$（echo${mapfile[1]}）；file2=$（echo${mapfile[2]}）；join-11-21-a1-a2-o1.1.2,2.2-e0您正在子shell和指定变量中执行mapfile
${MAPFILE[@]}
无法从父进程访问
请尝试以下方式：
cat list.txt | ( mapfile -t; echo "${MAPFILE[@]:0:2}" ) | xargs join -11 -21 -a1 -a2 -o1.1,1.2,2.2 -e0 > countmatrix.txt

考虑到这种情况，list.txt中定义的文件名包含空格
和/或其他特殊字符，更安全的说法是：
cat list.txt | ( mapfile -t; printf "%s\0" "${MAPFILE[@]:0:2}" ) | xargs -0 join -11 -21 -a1 -a2 -o1.1,1.2,2.2 -e0 > countmatrix.txt

两次引用的尝试都失败，因为它们尝试读取一个子外壳中的映射文件，并使用管道的第二个子外壳中的值。在sh*外壳中，变量从父子外壳传递到子子子外壳。管道的每个元素都在作为主外壳子外壳的子外壳中执行
因此，来自管道一部分的变量对管道的其他部分不可用（例如a=5 | echo$a
将不起作用）
在这种情况下：
（mapfile…）在子shell中执行，读取mapfile
“join”在单独的不相关子shell中执行，不能使用MAPFILE
简单的解决方案是读取主shell（或中间子shell）中的映射文件，如下所示
# Read MAPFLE
mapfile -t < list.txt
# EXecute join, use  MAPFILE
join -11 -21 -a1 -a2 -o1.1,1.2,2.2 -e0 ${MAPFILE[1]} ${MAPFILE[2]} >countmatrix.txt

#阅读MAPFLE
映射文件-tcountmatrix.txt

表面上，不需要将任何内容通过管道传输到join命令中，该命令使用命名文件进行输入（忽略stdin）
“真正”的解决方案（65个文件）应该在循环中包含连接，而不是单个连接。
可以显示一些示例输入和输出，比如2或3个文件，而不是65个文件吗？输入是list.txt，这是一个文件名列表，每个文件名都出现在新行上。由于连接抛出额外的操作数错误，代码的第一行没有输出。其他策略是utput countmatrix.txt为空文件。感谢您对子进程和父进程的解释。xargs失败，因为MAPFILE长度超过2个元素，join将其他元素解释为额外操作数。明白。我已相应地更正了我的答案。但是，如果您要参考剩余的（第三个或更高版本）${MAPFILE[@]}
随后，最好在父级（当前）中执行MAPFILE
以@dash-o写入的方式处理。感谢您的详细解释。在最终脚本中，连接存在于映射文件数组内容的for循环中。在运行最终脚本之前，我试图在命令行上验证脚本组件，但遇到此错误。