意外'；（'；在bash中）

我有以下脚本：

#!/bin/sh

# Use the PhiPack software on our two aligned sets of sequences...
mkdir FcFeABC
cd FcFeABC
../bin/PhiPack/Phi -f ../../Data/Real_Sequences_and_Networks/FcFeABC_alignment.fas -o -v -w 10 -g
cd -

mkdir FcL10
cd FcL10
../bin/PhiPack/Phi -f ../../Data/Real_Sequences_and_Networks/FcL10_alignment.fas -o -v -w 10 -g
cd -

# Use the PhiPack software on the simulated Datasets...
cd ../Data/Simulated_Sequences_and_Networks/Constant_Sex/Theta\ =\ 0.066/Theta\ =\ 0.066/Medium/CutSequences/;
rmus=($(ls -d *.fas))
cd -
absfiles=(../Data/Simulated_Sequences_and_Networks/Constant_Sex/Theta\ =\ 0.066/Theta\ =\ 0.066/Medium/CutSequences/*.fas)
if [ ${#rmus[@]} = ${#absfiles[@]} ]
then
    mkdir ${rmus[@]}
    for ((i=0; i<${#absfiles[@]}; i++));
    do
        cd ${rmus[$i]}
    .../bin/PhiPack/Phi -f ${absfiles[$i]} -o -v -w 10 -g
        cd -
    done
else
    echo "Error, Number of files created and files to be read differs"
fi

这是哪一行：

rmus=($(ls -d *.fas))

我不明白为什么“（”是意外的-它只是将ls的结果分配给一个数组

谢谢，

---

Ben W.

您不是在用

bash

运行它。您是在用您的shebang行

#！/bin/sh

中的

/bin/sh

运行它

使用

bash

显式运行

bash runPhiTests.sh

或修复您的shebang行

#！/bin/bash

尝试使用#！/bin/bash代替sh。

#！/bin/sh

应该是

#！/bin/bash

rmus=($(ls -d *.fas))