在文件之间匹配列，并使用terminal/powershell/命令行Bash中的数据组合生成文件

我有两个不同长度的.txt文件，希望执行以下操作：

如果文件1的第1列中的值出现在文件3的第1列中，则打印文件2的第2列，然后打印与文件1对应的整行

已经尝试了awk的排列，但是我到目前为止还没有成功

谢谢大家!

文件1：

MARKERNAME EA NEA BETA SE
10:1000706 T C -0.021786390809225 0.519667838651725
1:715265 G C 0.0310128798578049 0.0403763946716293
10:1002042 CCTT C 0.0337857775471699 0.0403300629299562

文件2：

CHR:BP SNP  CHR BP  GENPOS  ALLELE1 ALLELE0 A1FREQ  INFO    
1:715265 rs12184267 1   715265  0.0039411   G   C   0.964671
1:715367 rs12184277 1   715367  0.00394384  A   G   0.964588

所需文件3：

SNP        MARKERNAME EA NEA BETA SE
rs12184267 1:715265 G C 0.0310128798578049 0.0403763946716293

尝试：

awk -F'|' 'NR==FNR { a[$1]=1; next } ($1 in a) { print $3, $0 }' file1 file2
awk 'NR==FNR{A[$1]=$2;next}$0 in A{$0=A[$0]}1' file1 file2

---

有了你们展示的样品，你们能试一下下面的吗

awk '
FNR==1{
  if(++count==1){ col=$0 }
  else{ print $2,col }
  next
}
FNR==NR{
  arr[$1]=$0
  next
}
($1 in arr){
  print $2,arr[$1]
}
' file1 file2

说明：增加对以上内容的详细说明

awk '                              ##Starting awk program from here.
FNR==1{                            ##Checking condition if this is first line of file(s).
  if(++count==1){ col=$0 }         ##Checking if count is 1 then set col as current line.
  else{ print $2,col }             ##Checking if above is not true then print 2nd field and col here.
  next                             ##next will skip all further statements from here.
}
FNR==NR{                           ##This will be TRUE when file1 is being read.
  arr[$1]=$0                       ##Creating arr with 1st field index and value is current line.
  next                             ##next will skip all further statements from here.
}
($1 in arr){                       ##Checking condition if 1st field present in arr then do following.
  print $2,arr[$1]                 ##Printing 2nd field, arr value here.
}
' file1 file2                      ##Mentioning Input_files name here.

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有了你们展示的样品，你们能试一下下面的吗

awk '
FNR==1{
  if(++count==1){ col=$0 }
  else{ print $2,col }
  next
}
FNR==NR{
  arr[$1]=$0
  next
}
($1 in arr){
  print $2,arr[$1]
}
' file1 file2

说明：增加对以上内容的详细说明

awk '                              ##Starting awk program from here.
FNR==1{                            ##Checking condition if this is first line of file(s).
  if(++count==1){ col=$0 }         ##Checking if count is 1 then set col as current line.
  else{ print $2,col }             ##Checking if above is not true then print 2nd field and col here.
  next                             ##next will skip all further statements from here.
}
FNR==NR{                           ##This will be TRUE when file1 is being read.
  arr[$1]=$0                       ##Creating arr with 1st field index and value is current line.
  next                             ##next will skip all further statements from here.
}
($1 in arr){                       ##Checking condition if 1st field present in arr then do following.
  print $2,arr[$1]                 ##Printing 2nd field, arr value here.
}
' file1 file2                      ##Mentioning Input_files name here.

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欢迎来到SO，请在您的问题中添加3个简单的内容。第一个-输入样本，第二个-输出样本，第三个-你以代码的形式所做的努力，这将使你的问题变得清晰。不是我的反对票，顺便说一句，谢谢你。@CEL:你没有发布任何代码，所以很难讨论这个问题。抱歉-已修改。谢谢大家!@CEL，这是对你的问题的很好的编辑，谢谢你这么做。@RavinderSingh13如果col 1 MAKERNAME file 1=col 1 file 2 CHR:BP，打印col 2 file 2 SNP和所有文件1数据欢迎这么做，请在你的问题中添加3件简单的事情。第一个-输入样本，第二个-输出样本，第三个-你以代码的形式所做的努力，这将使你的问题变得清晰。不是我的反对票，顺便说一句，谢谢你。@CEL:你没有发布任何代码，所以很难讨论这个问题。抱歉-已修改。谢谢大家!@CEL，这是对您的问题的很好的编辑，谢谢您这么做。@RavinderSingh13如果col 1 MAKERNAME file 1=col 1 file 2 CHR:BP，请打印col 2 file 2 SNP和所有文件1数据