Bash 如何在启动neo4j docker容器时运行cypher脚本？ 背景

我以前在Windows上安装了neo4j，并使用PowerShell脚本来运行一些迁移。每次都会从这些迁移脚本和导入文件夹中的一些CSV中重新创建数据库。NETWebAPI与Neo4JDB对话

目标 我决定将此设置归档，这样我就可以与其他人跨平台协作，而不必直接安装/配置neo4j

我已经设置了neo4j docker容器的大部分内容——卷、复制的适当文件等，然后它就启动了

问题 不管怎样，我似乎找不到一种插入或执行脚本的好方法，该脚本将在文件夹中循环并执行密码查询。我知道这可能必须是一个使用neo4j CLI的bash脚本，我对此很满意，但我找不到一个好的地方来实现它

我试过的

• EXTENSION\u脚本

  env变量。这在过程中执行得太早了
• 使用我自己的

  入口点

  ——发现它似乎取代了neo4j容器的入口点
• 使用我自己的

  CMD

  ——类似地，这似乎取代了
• 从

  docker compose

  移动到

  dockerfile

  并复制neo4j入口点文件进行修改。这似乎遇到了一个问题，出现了一个我正在研究的错误

  无效选项n/bash:-

  ，但这是我的第一步

问题: 在Neo4j启动后，如何运行一个或多个密码查询？neo4j或docker中是否有相关规定？我在文档中找不到任何线索

或者，这真的不是推荐的方式吗？我应该通过输入容器并手动运行与CLI配合使用的bash脚本来按需运行这些迁移吗

剧本 Dockerfile：

FROM neo4j:3.3.1

COPY ./data/import/migrations/scripts /scripts

ENV NEO4J_AUTH=none

ENTRYPOINT ["/scripts/docker-neo4j-entrypoint.sh"]
CMD ["neo4j"]

来自docker compose的相关代码片段：

  neo4j:
    container_name: 'app-db'
    build:
      context: .
      dockerfile: DOCKERFILE_DB
    volumes:
      - ./data/CSVs:/import
      - ./data/import/migrations:/import/migrations
    ports: 
      - "7687:7687" # bolt protocol
      - "7474:7474" # http protocol
      - "7473:7473" # https protocol
    networks:
      - app-network

---

我也遇到了同样的问题，我想在启动时创建一些索引，并能够根据文档解决它，创建一个包装器脚本和一个索引脚本，该脚本在neo4j备份之前一直处于休眠状态，如下所示：

Dockerfile

FROM neo4j:latest

ENV NEO4J_AUTH=neo4j/password

RUN apk add --no-cache --quiet procps

COPY create-indexes.sh create-indexes.sh
COPY wrapper.sh wrapper.sh

ENTRYPOINT ["./wrapper.sh"]

wrapper.sh：

#!/bin/bash

# turn on bash's job control
set -m

# Start the primary process and put it in the background
/docker-entrypoint.sh neo4j &

# Start the helper process
./create-indexes.sh

# the my_helper_process might need to know how to wait on the
# primary process to start before it does its work and returns


# now we bring the primary process back into the foreground
# and leave it there
fg %1

create-index.sh

#!/bin/bash

until cypher-shell -u neo4j -p shaun123 'CREATE INDEX ON :Page(url);'
do
  echo "create page index failed, sleeping"
  sleep 10
done

until cypher-shell -u neo4j -p shaun123 'CREATE INDEX ON :Visited(url);'
do
  echo "create visited index failed, sleeping"
  sleep 10
done

until cypher-shell -u neo4j -p shaun123 'CREATE INDEX ON :Anchor(url);'
do
  echo "create anchor index failed, sleeping"
  sleep 10
done

---

我还将此作为一个问题打开，并将我的答案复制到其中，然后关闭。

意识到我已经解决了这个问题——某种程度上——并想在这里发布我当前的工作解决方案。我不打算将我自己的答案标记为解决方案，因为我相信这里的另一个解决方案也是可行的，我不想完全相信

总的组成部分是：

• docker使用环境变量（是否运行迁移以及等待多长时间）编写文件
• 包含Neo4j客户端的我的WebAPI项目的

  Dockerfile

• 运行迁移的bash入口点脚本

docker编写文件 在API项目上设置neo4j和环境变量

version: '3'

services: # these are all the services that a docker app uses

  api: # this is the name of the service we're creating; it's chosen by us. Here, we're calling it "api".
    container_name: 'redacted-api' # this is the name of the container to us
    depends_on:
      - neo4j
    build:
      context: .
      dockerfile: DOCKERFILE_API
    environment:
      - SECONDS_PAUSE_BEFORE_MIGRATION=15
      - RUN_MIGRATIONS=true
    ports:
    - "5000:10901"
    networks:
      - app-network # this is a docker feature to allow you to place your various services within a virtual network so they can talk to each other. Note all the services we define here use the "app-network" network.
  neo4j:
    image: neo4j:3.3.1-enterprise
    container_name: 'redacted-db'
    environment: 
      - NEO4J_AUTH=none
      - NEO4J_dbms_security_procedures_unrestricted=apoc.*
      - NEO4J_ACCEPT_LICENSE_AGREEMENT=yes
    volumes:
      - ./data/db-files:/data
      - ./data/CSVs:/import
      - ./data/import/migrations:/import/migrations
      - ./data/plugins:/plugins
    ports: 
      #TODO: Remove these so that the API can get to them but not the host? (security)
      - "7687:7687" # bolt protocol
      - "7474:7474" # http protocol
      - "7473:7473" # https protocol
    networks:
      - app-network

networks:
  app-network:
    driver: bridge

API Dockerfile 在安装my WebAPI的容器上安装

cypher shell

neo4j实用程序：

FROM microsoft/dotnet:2.1-sdk

# Add the neo4j repo to the packages list
RUN wget -O - https://debian.neo4j.org/neotechnology.gpg.key | apt-key add -
RUN echo 'deb http://debian.neo4j.org/repo stable/' | tee -a /etc/apt/sources.list.d/neo4j.list

# Grab the packages list & install neo4j
RUN apt-get update && apt-get install -y \
cypher-shell

COPY . /app
WORKDIR /app/src/Redacted.API

RUN ["dotnet", "build"]

EXPOSE 10901/tcp

ENTRYPOINT ["sh", "/app/entrypoint.sh"]

入口点脚本 这在Web API的容器上运行，循环执行迁移文件夹中的任何cypher查询，并针对Neo4j容器执行它们

#/bin/bash
如果[“$RUN_MIGRATIONS”=“true”]；然后
echo“暂停$SECONDS\u暂停\u然后再\u迁移秒，让Neo4j预热”
休眠$SECONDS\u在\u迁移之前暂停\u
回显“运行迁移”
用于/app/data/import/migrations/*.cypher中的文件名；做
echo“正在尝试运行密码：$filename”
内容=$（目录$filename）
密码壳-abolt://redacted-db:7687 “$contents”
完成
其他的
echo“正在跳过迁移，因为RUN_migrations未设置为true。”
fi
echo“启动.NET WebAPI”
网络运行

最终结果

• DB容器首先启动
• API依赖于Neo4j，因此它会等待容器启动配置的时间
• API然后运行所有迁移

进一步步骤

---

最后我不得不把它放在一边，但接下来我要做的是找出如何将Dockerfile/migrations/entrypoint完全放在Neo4j容器中，我想，如果我没有找到这种对我来说足够有效的方法，我本可以做得更细致一些。

我创建了一个docker映像，可以与这里和github问题中的包装器重构版本一起重用

图像

marcellodesales/neo4j，含香附种子

• Docker图像位于
• 使用协议

  bolt://

  对数据进行种子设定

  • cypher shell-f文件

    不工作

密码

• 任何包含cypher内容的文件，如

  interviews.cql

Docker图像

• 将密码文件装入卷

  /cyphers

利润

• 让服务器加载密码

• 结果如下

---

仅供参考，我目前正在实施使用API入口点为数据库种子的策略。好吧，看看结果如何。可能是@SeanKilleen的复制品很高兴你喜欢它。。。我花了几个小时试图理解是什么导致了这些错误，直到我检查了您的包装器实现。。。我已经打开了在直接使用cyper_shell和-F文件时发现的bug。。在这种情况下，感谢您提出了第一个想法！

CREATE (facebook:Company {name:'Facebook'})

CREATE (clement:Candidate {name:'Clement'})
CREATE (antoine:Candidate {name:'Antoine'})
CREATE (simon:Candidate {name:'Simon'})

docker run --rm -ti  \
   -e "NEO4J_AUTH=none" \
   -p "7474:7474" -p "7687:7687" \
   -v $(pwd)/cypher_query.cql:/cyphers/interviews.cql \
   marcellodesales/neo4j-with-cypher-seed

$ docker run --rm -ti  \
   -e "NEO4J_AUTH=none" \
   -p "7474:7474" -p "7687:7687" \
   -v $(pwd)/cypher_query.cql:/cyphers/interviews.cql \
   marcellodesales/neo4j-with-cypher-seed
2020-09-27 16:54:00:486+0000 INFO  Wrapper: Waiting until neo4j stats at :7474 ...
Directories in use:
  home:         /var/lib/neo4j
  config:       /var/lib/neo4j/conf
  logs:         /logs
  plugins:      /var/lib/neo4j/plugins
  import:       /var/lib/neo4j/import
  data:         /var/lib/neo4j/data
  certificates: /var/lib/neo4j/certificates
  run:          /var/lib/neo4j/run
Starting Neo4j.
2020-09-27 16:54:01.394+0000 INFO  Starting...
2020-09-27 16:54:03.064+0000 INFO  ======== Neo4j 4.1.2 ========
2020-09-27 16:54:04.332+0000 INFO  Initializing system graph model for component 'security-users' with version -1 and status UNINITIALIZED
2020-09-27 16:54:04.337+0000 INFO  Setting up initial user from defaults: neo4j
2020-09-27 16:54:04.338+0000 INFO  Creating new user 'neo4j' (passwordChangeRequired=true, suspended=false)
2020-09-27 16:54:04.345+0000 INFO  Setting version for 'security-users' to 2
2020-09-27 16:54:04.349+0000 INFO  After initialization of system graph model component 'security-users' have version 2 and status CURRENT
2020-09-27 16:54:04.354+0000 INFO  Performing postInitialization step for component 'security-users' with version 2 and status CURRENT
2020-09-27 16:54:04.513+0000 INFO  Bolt enabled on 0.0.0.0:7687.
2020-09-27 16:54:05.410+0000 INFO  Remote interface available at http://localhost:7474/
2020-09-27 16:54:05.411+0000 INFO  Started.
2020-09-27 16:54:05:619+0000 INFO  Wrapper: Deleting all relations
2020-09-27 16:54:08:274+0000 INFO  Wrapper: Wrapper: Loading cyphers from '/cyphers'
2020-09-27 16:54:08:275+0000 INFO  Wrapper: Running cypher /cyphers/interviews.cql
0 rows available after 330 ms, consumed after another 0 ms
Added 17 nodes, Created 17 relationships, Set 34 properties, Added 17 labels
2020-09-27 16:54:09:695+0000 INFO  Wrapper: Finished loading all cyphers from '/cyphers'
2020-09-27 16:54:10:842+0000 INFO  Wrapper: Wrapper: Changes count 17
/docker-entrypoint.sh neo4j