Bioinformatics 无法识别的选项：I picard.jar

我正在尝试使用picard.jar将BMA文件转换为FASTQ格式。这是我的命令：

java -jar /opt/picard-tools/picard.jar SamToFastq \ I=chr2chr3.bam \ FASTQ=chr2chr3.f1.fastq \ SECOND_END_FASTQ=chr2chr3.f2.fastq

但是，我收到了以下错误消息：

错误：无法识别的选项：I

我完全糊涂了，有什么想法吗？

试试：

java -jar /opt/picard-tools/picard.jar SamToFastq \ 'I=chr2chr3.bam' \ FASTQ=chr2chr3.f1.fastq \ SECOND_END_FASTQ=chr2chr3.f2.fastq

尝试：

java -jar /opt/picard-tools/picard.jar SamToFastq \ 'I=chr2chr3.bam' \ FASTQ=chr2chr3.f1.fastq \ SECOND_END_FASTQ=chr2chr3.f2.fastq

去掉反斜杠

java -jar /opt/picard-tools/picard.jar SamToFastq  I=chr2chr3.bam  FASTQ=chr2chr3.f1.fastq  SECOND_END_FASTQ=chr2chr3.f2.fastq

注:

• 您可以压缩FASTQ，忽略BAM中的小错误
  java-jar/opt/picard tools/picard.jar SamToFastq I=chr2chr3.bam FASTQ=chr2chr3.f1.FASTQ.gz第二次\u结束\u FASTQ=chr2chr3.f2.FASTQ.gz验证\u严格性=宽松

• 对于生物信息学问题，你最好问或

去掉反斜杠

java -jar /opt/picard-tools/picard.jar SamToFastq  I=chr2chr3.bam  FASTQ=chr2chr3.f1.fastq  SECOND_END_FASTQ=chr2chr3.f2.fastq

注:
• 您可以压缩FASTQ，忽略BAM中的小错误
  java-jar/opt/picard tools/picard.jar SamToFastq I=chr2chr3.bam FASTQ=chr2chr3.f1.FASTQ.gz第二次\u结束\u FASTQ=chr2chr3.f2.FASTQ.gz验证\u严格性=宽松

• 对于生物信息学问题，你最好问或

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幽默评论：也许你需要打电话给USS enterprise:-）。这些反斜杠是什么？幽默评论：也许你需要打电话给USS enterprise:-）。这些反斜杠是什么？