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PETSc示例不起作用

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PETSc示例不起作用,c,makefile,cygwin,petsc,C,Makefile,Cygwin,Petsc,我有Windows7操作系统。 我遵守了来自政府的指示；在VS 2005的命令提示符中，我打开了cygwin并使用以下命令安装了PETSc： ./configure --with-cc='win32fe cl' --with-fc=0 --with-mpi=0 --download-f2cblaslapack 我尝试从网页上运行以下示例： cd src/ksp/ksp/examples/tutorials make ex2 ex2.c是一个c程序代码。我得到以下错误： $ make ex2

我有Windows7操作系统。 我遵守了来自政府的指示；在VS 2005的命令提示符中，我打开了cygwin并使用以下命令安装了PETSc：

./configure --with-cc='win32fe cl' --with-fc=0 --with-mpi=0 --download-f2cblaslapack
我尝试从网页上运行以下示例：

cd src/ksp/ksp/examples/tutorials

make ex2
ex2.c是一个c程序代码。我得到以下错误：

$ make ex2

makefile:18: /conf/variables: No such file or directory

makefile:19: /conf/rules: No such file or directory

makefile:1151: /conf/test: No such file or directory

make: *** No rule to make target `/conf/test'.  Stop.
这是什么原因造成的

（更重要的是） 我怎么修理它

*编辑：我也可以用一个一般性的答案，因为目前我甚至不知道用谷歌搜索什么，我也不想联系PETSc支持部门了解一切

我决定在Ubuntu上工作。那么现在，交易是这样的。安装后，我写：

gcc-I$PETSC_DIR/包括-L$PETSC_DIR/$PETSC_ARCH/lib-libpetsc ex2

在命令行中。我得到了埃罗斯按摩：

/usr/bin/ld:找不到-libpetsc ex2:在函数
\u start'中：
（.text+0x1bc4）：多重定义
\u start' /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/../../../../x86_64-linux-gnu/crt1.o:（.text+0x0）：首先在此处定义 ex2:在函数
\u fini'中：
（.fini+0x0）：多重定义
\u fini' /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/../../../../x86_64-linux-gnu/crti.o:（.fini+0x0）：首先在此处定义 ex2:（.rodata+0x0）：使用了
\u IO\u stdin\u的多个定义'
/usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/../../../../x86_64-linux-gnu/crt1.o:（.rodata.cst4+0x0）：首先在这里定义
ex2:在函数中
\u数据\u开始'： （.data+0x0）
\u data\u start'的多个定义
/usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/../../../../../x86_64-linux-gnu/crt1.o:（.data+0x0）：首先在此处定义
ex2:在函数中
\u数据\u开始'： （.data+0x8）
的多个定义
/usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/crtbegin.o:（.data+0x0）：首先在这里定义
ex2:在函数中
\u init'： （.init+0x0）“\u init”的多个定义 /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/../../../../x86_64-linux-gnu/crti.o:（.init+0x0）：首先在此处定义 collect2:ld返回了1个退出状态

如下面章节所述，遇到问题了吗？对于与
make
相关的问题，您需要设置configure打印的
PETSC\u DIR
和
PETSC\u ARCH

这是什么原因造成的？：
src/ksp/ksp/examples/tutorials
目录中的
makefile
引用
PETSC\u DIR
以包含配置文件，即

include ${PETSC_DIR}/conf/variables
include ${PETSC_DIR}/conf/rules

...
include ${PETSC_DIR}/conf/test
现在，当您像执行
make ex2
一样执行
make
（从错误中可以看出，您没有设置
PETSC\u DIR
变量），
${PETSC\u DIR}
为空，因此
make
尝试包含
/conf/variables
，
/conf/rules
&
/conf/test
不存在的文件

如何修复它？
您必须运行网站上提到的
make

make PETSC\u DIR=PETSC\u ARCH=ex2

在此之前，您需要正确构建源代码。为了澄清您在问题
/configure…
中提到的内容，不安装PETSc，而只配置用于构建的源代码。您需要运行
make
。当您运行
configure
时，如果成功，它将输出配置详细信息，包括
PETSC\u DIR
和
PETSC\u ARCH
。样本输出：

./configure --with-mpi=0
===============================================================================
             Configuring PETSc to compile on your system                       
===============================================================================
TESTING: alternateConfigureLibrary from PETSc.packages.petsc4py(config/PETSc/packages/petsc4py.py:65)                                                                   Compilers:
...
...
PETSc:
  PETSC_ARCH: arch-linux2-c-debug
  PETSC_DIR: /XXXX/petsc-3.3-p1
  Clanguage: C
  Scalar type: real
  Precision: double
  shared libraries: disabled
  dynamic loading: disabled
  Memory alignment: 16
xxx=========================================================================xxx
 Configure stage complete. Now build PETSc libraries with (cmake build):
   make PETSC_DIR=/XXXX/petsc-3.3-p1 PETSC_ARCH=arch-linux2-c-debug all
 or (experimental with python):
   PETSC_DIR=/XXXX/petsc-3.3-p1 PETSC_ARCH=arch-linux2-c-debug ./config/builder.py
xxx=========================================================================xxx
然后您已经运行了
make PETSC_DIR=/XXXX/PETSC-3.3-p1 PETSC_ARCH=ARCH-linux2-c-debug all
，如
configure
的输出中所述。这将建立图书馆。现在您应该能够构建示例了。（请注意，这是在Linux上运行的，您应该可以在cygwin上执行同样的操作）
旁注：似乎不需要设置
PETSC_ARCH
来构建示例，您应该能够使用
make PETSC_DIR=ex2构建


希望这有帮助
 我也有同样的问题。你只需要一次修复。在显示上述错误的makefile中，只需为makefile中的
PETSC_DIR
变量提供值。比如说，对我来说是

PETSC_DIR=/Users/kanikas/Documents/research/PETSC/PETSC-3.5.2


注意：
PETSC\u DIR
应该是PETSC的根目录。
我正在~/.bashrc中直接添加导出路径。这样我就不需要一遍又一遍地写路径


sudo nano ~/.bashrc


转到文件的最后一行：


#PETScXXX
export PETSC_DIR=/home/username/PETSc/petsc-3-8
export PETSC_ARCH=arch-linux2-c-debug


每次启动shell时，您都可以访问正确的petsc路径和库

我希望这能对某人有所帮助。

（运行Xubuntu 16.04 64位）
很好。我忘了提。在运行上面提到的“/configure…”代码后，我按照提示要求执行了操作，即“make PETSC_DIR…”等。我甚至了解到库编译是成功的。之后，“makeex2”报告了我问题中提到的错误。现在，当我尝试运行“make PETSC_DIR…..ex2”并添加命令“PETSC_DIR…..”时，正如您所提到的，它至少对我有帮助（打印出一些文件夹的行）。我真的不知道我得到的是否正确，但这绝对不是一个错误。@user1487833:那么您能够构建和执行这些示例吗？如果没有，您可以发布控制台消息。也许有些事情可以解决我已经建立了这个例子，是的。谢谢。您可以将变量放在背景标记中，以便为其添加语法突出显示，同样，代码块也可以缩进四个空格：。