Command line 爆炸+；本地配置：如何配置nt和nr数据库？

我正在mac上配置Blast+（操作系统sierra），在配置本地下载的nr和nt数据库时遇到问题。我正试图按照NCBI的指示进行操作，并且在配置和示例执行步骤上遇到了问题

他们说要更改我的.bash_配置文件，使其显示：

export PATH=$PATH:$HOME/Documents/Luke/Research/Pedulla\ 17-18/blast/ncbi-blast-2.6.0+/bin

这很好，他们说为BLASTDB“类似地”配置一个路径，但要配置到我的DB所在的文件，所以我已经这样做了：

export BLASTDB=$BLASTDB:$HOME/Documents/Luke/Research/Pedulla\ 17-18/blast/blastdb/nt.00

它指定了我从他们的FTP解压nt tar文件时得到的确切文件夹。使用此路径，如果我运行命令

blastn -query test_query.fa -db nt.00 -task blastn -outfmt "7 qseqid sseqid evalue bitscore" -max_target_seqs 5

然后它成功运行，我得到了结果，但我担心这些结果只会被检查整个nt.00数据库文件的nt.00部分，特别是因为如果我在Web Blast上运行test_query.fa序列，我会得到不同的结果

另外，他们的说明说，路径只需要指向包含整个数据库文件夹nt.00的文件夹，从我解压缩的tar中——而不是特定的nt.00本身——在我的例子中，它只是“blastdb/”（与“blastdb/nt.00/”相反，后者包含nt.00.nhd、nt.00.nal等）。这是有意义的，因为当我工作时，我希望通过更改命令上的-db标志，能够在nt数据库上blastn，但也能在nr数据库上blastp，等等，并且将它们全部放在这个文件夹中应该不会有问题，对吗？但是，如果我必须指定BLASTDB的路径，并在末尾添加nt.00db，那么我怎么能在同一个文件夹（BLASTDB/）中使用nr.00呢基本上，我想按照说明所说的去做，就这样：

export BLASTDB=$BLASTDB:$HOME/Documents/Luke/Research/Pedulla\ 17-18/blast/blastdb/

然后，根据我想要使用的数据库，我可以在命令的-db标志后这样说。但是当我像上面那样做路径时，它给了我这个错误：

BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database [nt] in search path [/Users/LJStout::/Users/LJStout/Documents/Luke/Research/Pedulla 17-18/blast/blastdb:]

我尝试过从上面运行同一个blastn命令，并将“nt”替换为“nt.00”，并且尝试过这些命令，BLASTDB的路径以“BLASTDB/”和“BLASTDB/nt”结尾，当然还有“BLASTDB/nt.00”，这是唯一一个运行没有错误的命令

在我读到的另一篇文章中，OP担心他的执行没有检查整个nt.00文件夹，但这与我的问题不同

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谢谢你的帮助

整个问题归结为nt.00&nr.00文件，即解压其各自的.tar.gz后产生的原始文件夹，在相同的父文件夹中，而它们的内容应该在相同的父文件夹中。我只是删除了它们进入的文件夹，并将内容复制到我的新文件夹中，单亲父母。我被指示误导了，这是个简单的错误。现在，我有一个文件夹，

blastdb/

，其中包含我计划使用的每个数据库的所有内容，包括nt、nr和refseq

为您提供信息，这里还有一个生物信息学stackexchange网站：谢谢，我错贴在这里了。