C++ 由于cpp11编译错误，R tidyr程序包安装失败（扩展模式x不包含参数包）_C++_R_Tidyverse_Tidyr

C++ 由于cpp11编译错误，R tidyr程序包安装失败（扩展模式x不包含参数包）

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C++ 由于cpp11编译错误，R tidyr程序包安装失败（扩展模式x不包含参数包）,c++,r,tidyverse,tidyr,C++,R,Tidyverse,Tidyr,我有以下与cp11相关的错误。看起来cp11编译有一些错误，我不知道如何解决我试着卸载这个软件包，然后重新安装我在RHEL7上，gcc版本是4.8.5 > install.packages("tidyverse") Installing package into ‘/datascience/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.6’ (as ‘lib’ is unspecified) also installing the dep

我有以下与cp11相关的错误。看起来cp11编译有一些错误，我不知道如何解决

我试着卸载这个软件包，然后重新安装

我在RHEL7上，gcc版本是4.8.5

> install.packages("tidyverse")
Installing package into ‘/datascience/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.6’
(as ‘lib’ is unspecified)
also installing the dependency ‘tidyr’

trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/tidyr_1.1.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 879411 bytes (858 KB)
==================================================
downloaded 858 KB

trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/tidyverse_1.3.0.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 712837 bytes (696 KB)
==================================================
downloaded 696 KB

* installing *source* package ‘tidyr’ ...
** package ‘tidyr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** libs
g++ -m64 -std=gnu++11 -I"/usr/include/R" -DNDEBUG  -I"/usr/lib64/R/library/cpp11/include" -I/usr/local/include  -fpic  -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches   -m64 -mtune=generic  -c cpp11.cpp -o cpp11.o
In file included from /usr/lib64/R/library/cpp11/include/cpp11/as.hpp:8:0,
                 from /usr/lib64/R/library/cpp11/include/cpp11.hpp:5,
                 from /usr/lib64/R/library/cpp11/include/cpp11/declarations.hpp:8,
                 from cpp11.cpp:4:
/usr/lib64/R/library/cpp11/include/cpp11/protect.hpp: In lambda function:
/usr/lib64/R/library/cpp11/include/cpp11/protect.hpp:185:52: error: parameter packs not expanded with ‘...’:
       return unwind_protect_sexp([&] { return ptr_(a...); });
                                                    ^
/usr/lib64/R/library/cpp11/include/cpp11/protect.hpp:185:52: note:         ‘a’
/usr/lib64/R/library/cpp11/include/cpp11/protect.hpp:185:53: error: expansion pattern ‘a’ contains no argument packs
       return unwind_protect_sexp([&] { return ptr_(a...); });
                                                     ^
make: *** [cpp11.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘tidyr’
* removing ‘/datascience/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.6/tidyr’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘tidyr’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘tidyr’ is not available for package ‘tidyverse’
* removing ‘/datascience/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.6/tidyverse’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘tidyverse’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/Rtmp7JHlRI/downloaded_packages’

更新版本的gcc将按照@Maurits Evers所述正确编译tidyr

#Enable the rhscl repository
yum-config-manager --enable rhel-server-rhscl-7-rpms

#Install devtooset-X
yum install devtoolset-X

#Open a shell with the required environment variables.
scl enable devtoolset-X bash

然后打开一个R壳。如果在非交互式脚本中使用，请获取scl enable文件，该文件将在当前shell中设置环境变量

 source /opt/rh/devtoolset-X/enable

我正处于完全相同的情况下：试图在R3.6.1上安装tidyr，在cpp11和相同版本的gcc（4.8.5）中出现此错误

但是：

install.packages(
+pkgs=“tidyr”，
+依赖项=真，
+回购协议=”https://cloud.r-project.org"
+ )
将软件包安装到“/dados/home/t03999/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6”中
（由于“lib”未指定）
正在尝试URL'https://cloud.r-project.org/src/contrib/tidyr_1.1.1.tar.gz'
内容类型“应用程序/x-gzip”长度879411字节（858 KB）
==================================================
下载858KB
*正在安装*source*包“tidyr”。。。
**包裹“tidyr”已成功解包并检查MD5金额
**使用分阶段安装
**自由基
g++-m64-std=gnu++11-I“/usr/lib64/R/./../include/R“-DNDEBUG-I”/dados/home/t03999/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/cpp11/include“-I/systemr/port/linux-X64/include/zlib-I/systemr/port/port/linux/port/linux-X64/port/linux-cppo-11.cppo-cppo
cpp11.cpp：在函数“sexprc*”中，输入（SEXP）：
cpp11.cpp:10:43:错误：“unmove”不是“cpp11”的成员
10 |返回cpp11:：as_sexp（fillDown（cpp11:：unmove（cpp11:：as_cpp（x）））；
|                                           ^~~~~~
cpp11.cpp：在函数“sexprc*”中，tidyr\u fillUp（SEXP）”：
cpp11.cpp:17:41:错误：“unmove”不是“cpp11”的成员
17 |返回cpp11:：as_sexp（fillUp（cpp11:：unmove（cpp11:：as_cpp（x）））；
|                                         ^~~~~~
cpp11.cpp：在函数“SEXPREC*”中，tidyr\u melt\u数据帧（SEXP，SEXP，SEXP，SEXP，SEXP，SEXP，SEXP）”中：
cpp11.cpp:24:49:错误：“unmove”不是“cpp11”的成员
24 |返回cpp11:：as|sexp（melt|u数据帧（cpp11:：unmove（cpp11:：as|cpp（id|ind）），cpp11:：unmove（cpp11:：as|cpp（measure|ind）），cpp11:：unmove（cpp11:：as|cpp（变量名）），cpp11:：unmove（cpp11:：as||cpp（值名）），cpp11:：unmove（cpp11:：as||cpp）（值名）），cpp11:：unmove（cpp11:：as||cpp11:：as|cpp11:：as|cpp）（模板）），cpp11:：unmove（cpp11:：as_cpp（valueAsFactor）），cpp11:：unmove（cpp11:：as_cpp（variablesfactor））；
|                                                 ^~~~~~
cpp11.cpp:24:104:错误：“unmove”不是“cpp11”的成员

我们仍然不知道如何解决这个问题。

我猜是错误消息

 error: ‘unmove’ is not a member of ‘cpp11’

是由cpp11软件包的0.2.0版本中正在进行的更改引起的。这就提到了这个问题。解决我的问题的方法是在R中使用以下命令安装旧版本的cpp11：

packageurl <- "https://cloud.r-project.org/src/contrib/cpp11_0.1.0.tar.gz"
install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")

packageurl可能是您的gcc版本太旧了。您能发布gcc--version
的输出吗？Regcc
versions:可能是相关的，这反过来又链接到。最重要的是安装一个“devtoolset-7软件集合中更新的gcc版本”。@MauritsEvers我在RHEL7上，gcc版本是4.8。5@MauritsEvers谢谢你的问题链接。错误看起来是一样的。不幸的是，我没有权限免费更新此库以进行快速验证，但我会要求IT团队对其进行更新，以便检查它是否解决了问题。谢谢毛里塔尼亚，我想自从你发布这个后，URL已经改变了。我成功地使用了packageurl
packageurl <- "https://cloud.r-project.org/src/contrib/cpp11_0.1.0.tar.gz"
install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")