C++ 分子计算的存储系统

我目前正在进行MD模拟。它将分子位置存储在一个向量中。对于每个时间步，该向量被存储以在第二个向量中显示，从而产生

std::vector<std::vector<molecule> > data;

std:：矢量数据；

数据的大小

是

时间步长**sizeof（molecular）

，其中sizeof（molecular）是（已经减小）

3*sizeof（double）

，作为位置向量。但我仍然会因为时间步长和分子数量的增加而出现记忆问题

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因此，是否存在减少数据量的额外可能性？我目前的工作流程是首先计算所有分子，存储它们，然后使用每个步骤中每个分子的数据进行渲染，渲染是用Irrlicht完成的。（可能稍后使用blender）。

通过以单精度而不是双精度存储位置，您可以获得2倍的改进-如果不用于模拟，则足以进行渲染

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但最终需要将结果存储在文件中并脱机渲染

通过以单精度而不是双精度存储位置，您可以获得2倍的改进-如果不用于模拟，则足以进行渲染

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但最终需要将结果存储在文件中并脱机渲染

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< P>如果轨迹平滑，则可以考虑仅通过存储第N个步骤来压缩数据，并通过插值恢复中间位置。 如果时间步长很小，可以进行线性插值。三次样条曲线可以提供最高质量。无论如何，样条曲线系数的计算是一个全局操作，您最终只能执行该操作，并且需要额外的存储（！），您可能更喜欢基数样条曲线，它可以从四个连续位置在本地构建

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您真的需要保留所有的时间步长吗？您真的需要保留所有的时间步长吗？