C++ 在eclipse中包含外部makefile的多个子目录

我是调试CDT Eclipse中C++项目的Tyrun。我的项目结构是：

*Parent directory|
                |
                ----- SubDir 1
                |        |   
                |        |
                |        |
                |        |
                |       --- *.h and *.cpp  (header files and c++ source code)
                |       
                |
                |
                ----- SubDir 2
                        |
                        |
                        |
                        --- *.h and *.cpp  (header files and c+= source code)*

目前我有一个shell脚本，它编译所有内容并生成一个可执行文件。这个shell脚本有以下命令。它可以通过命令行正常工作

g++ -I SubDir1 -I SubDir2 Main.cpp SubDir1/*.cpp SubDir2/*.cpp -o exec

---

但是，

-I

在某种程度上无法与eclipse一起工作。是否有一种方法可以实现此eclipse。如何在外部或目标makefile中包含多个子目录。

在eclipse中创建C/C++项目时使用了哪个模板。它是可执行的、makefile还是autotools项目？显示makefile内容。你得到了什么错误？我可能错了，但我认为-I和目录之间不允许有空格。