docker run interactive与conda环境已激活

我想创建一个docker映像，这样当您以交互方式运行它时，conda环境已经激活

当前状态：

docker run -it my_image
(base) root@1c32ba066db2:~# conda activate my_env
(my_env) root@1c32ba066db2:~#

所需状态：

docker run -it my_image
(my_env) root@1c32ba066db2:~#

更多信息：

在Dockerfile中，我包含了安装conda、创建环境和激活环境所需的所有

运行

命令。相关部分转载如下

SHELL [ "/bin/bash", "--login", "-c" ]

...

# Install miniconda.
ENV CONDA_DIR $HOME/miniconda3
RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && \
    chmod +x ~/miniconda.sh && \
    ~/miniconda.sh -b -p $CONDA_DIR && \
    rm ~/miniconda.sh
# Make non-activate conda commands available.
ENV PATH=$CONDA_DIR/bin:$PATH
# Make conda activate command available from /bin/bash --login shells.
RUN echo ". $CONDA_DIR/etc/profile.d/conda.sh" >> ~/.profile
# Make conda activate command available from /bin/bash --interative shells.
RUN conda init bash

# Create and activate the environment.
RUN conda env create --force -f environment.yml
RUN conda activate my_env

当我运行此命令时，

conda activate my_env

似乎运行并成功。但是当我与docker run-it交互进入时，激活的环境是

（基本）

---

另外，我尝试让最后一个命令为

CMD conda activate my_env

，但它只是运行该命令，而没有进入交互模式。

每个

RUN

语句（包括

docker RUN

）都在新的shell中执行，因此，不能简单地在

RUN

命令中激活环境，并期望它在随后的

RUN

命令中继续处于活动状态

相反，您需要在shell初始化过程中激活环境。

SHELL

命令已经更改为包含

--login

，这非常好。现在您只需将

conda activate my_env

添加到

.profile

或

.bashrc

：

...
# Create and activate the environment.
RUN conda env create --force -f environment.yml
RUN echo "conda activate my_env" >> ~/.profile

确保这是在康达添加的部分之后