If statement 在if/then语句中使用shell变量时出现awk语法错误

我试图让下面的代码正常工作，但我一直在脚本的awk部分中发现语法错误

简单地说，我想计算一个截止值，并将其作为一个浮点数存储在一个数值变量中（例如，截止值）。我想将此变量传递给awk脚本，我尝试了该脚本，但仍然遇到语法问题，错误如下：

    awk: syntax error at source line 3
       context is
           >>> <<<

预期的输出应该是一个以制表符分隔的文件（例如，“Spl-129-run10_CUT.txt”），格式为

>Spl-129 TGGGGACC 80序列

在一天结束时，我想利用上面计算的截止变量来过滤小于截止值的序列（使用第三个字段中的值作为比较），条件是如果截止值小于4，则使用截止值2

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如果您能提供任何帮助，我们将不胜感激。谢谢

awk sniplet有多个问题。特别是，在

awk

脚本中似乎存在对

awk

的不必要调用：

 awk -v c="$cutoff" -v n="$name" '{ 
            if (c < 4) 
           awk '$3 > 2' tmp >n"_CUT.txt"; 

           else awk '$3 > c' tmp >n"_CUT.txt"; 
    }';

awk-vc=“$cutoff”-vn=“$name”{
if（c<4）
awk'$3>2'tmp>n“_CUT.txt”；
否则awk'$3>c'tmp>n“_CUT.txt”；
}';

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没有额外的细节（和样本输入），很难提供有效的解决方案。考虑发布样品输入和输出。特别是，目前还不清楚如何从输入中计算截止值。

请在您的问题中添加预期输出，然后让我们知道。如果您能全面概述您的需求，我相信我们可以在这方面提供更好的帮助。

 awk -v c="$cutoff" -v n="$name" '{ 
            if (c < 4) 
           awk '$3 > 2' tmp >n"_CUT.txt"; 

           else awk '$3 > c' tmp >n"_CUT.txt"; 
    }';