Java charAt方法出了什么问题？

节目的这一部分给我带来了麻烦。程序正在正确接收该文件。没有charAt方法，程序运行得很好。我真的不确定问题出在哪里。显然，这不是整个程序，只是给我一个错误的部分

错误：

java.lang.StringIndexOutOfBoundsException:字符串索引超出范围： 0位于java.lang.String.charAt（未知源代码），位于 GenSeq.main（GenSeq.java:111）位于 sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0（本机方法）位于 位于的sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke（未知源） sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke（未知源）位于 java.lang.reflect.Method.invoke（未知源代码）位于 edu.rice.cs.drjava.model.compiler.JavacCompiler.runCommand（JavacCompiler.java:272）

节目：

do{
   line = inputStream.nextLine();
   line = line.trim();

   if (line.charAt(0) == '>'){
   //Checking to see if it's an information line
   info = info + line;
   count++;
   //Used to count the number of entries
   }
   else{
     seq = seq + line;
     //Concatenating the sequence together
   }
 while (inputStream.hasNextLine());
 inputStream.close();

编辑：我们正在处理DNA和RNA序列，所以它只能从A、T、C、G或U开始处理我现在尝试的空白行。但仍然会出现错误

do{
       line = inputStream.nextLine();
       char first = line.charAt(0);

       if (first == '>'){
       //Checking to see if it's an information line
       info = info + line;
       count++;
       //Used to count the number of entries
       }

       if (first == 'A' || first == 'T' || first == 'G' || first == 'C' || first == 'U'){
         seq = seq + line;
       }
     }
     while (inputStream.hasNextLine());
     inputStream.close();

---

可能的解决方案是将

line.charAt（0）='>'

替换为

line.startsWith（“>”）

，至少这样可以消除数组的问题，并且您可以从那里完成调试。

您的文件中有空行吗？在这种情况下，您期望的行为是什么？您可以编写

System.out.println（line.charAt（0））是。文件中有空行。我希望trim方法可以处理这个问题。trim方法只删除尾随的空白字符，对您的例外情况毫无帮助。您认为
trim
有什么作用？如果有一行没有内容，则
字符串
为
“
”。没有
字符（0）
。