Java列表到Matlab矩阵的高效转换

我从Matlab调用googleprotocolbuffersjavaapi。这很有效，但我遇到了一个很大的性能瓶颈。大部分数据作为以下类型的对象返回：

java.util.Collections$UnmodifiableRandomAccessList

它们实际上包含一个浮动列表。我需要把它转换成Matlab矩阵。到目前为止，我发现最好的方法是：

cell2mat(cell(Q.toArray()))

然而，这一行是代码中的一个巨大性能瓶颈

注意，我知道FarSounder Matlab解析器生成器用于Google协议缓冲区，不幸的是它们非常慢。关于我的问题（YMMV）的一些粗略基准速度，请参见下文。高是好的

• 法拉第发声器Matlab:0.03
• 纯Python:1
• 从Matlab调用Java API（仅解析和提取元数据）：10
• 从Matlab调用的Java API（解析和提取元数据和数据）：0.25

如果不是因为转换

java.util.Collections$UnmodifiableRandomAccessList的开销

对于Matlab矩阵，那么从Matlab调用JavaAPI的方法看起来很有前途

有没有更好的方法将此Java对象转换为Matlab矩阵？

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请记住，返回此类型的方法是自动生成的代码。

您最好编写一小段额外的java代码，如下所示：

import java.util.List;
import java.util.ListIterator;

class Helper {
    public static float[] toFloatArray(List l) {
        float retValue[] = new float[l.size()];
        ListIterator iterator = l.listIterator();
        for (int idx = 0; idx < retValue.length; ++idx ){
            // List had better contain float values,
            // or else the following line will ClassCastException.
            retValue[idx] = (float) iterator.next();
        }
        return retValue;
    }
}

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根据我的经验，最有效的解决方案是编写一组java助手，将列表转换为原语类型的普通数组。 这些都通过matlab很好地映射到矩阵

如果上面的示例给出了一个

java.lang.Float

s数组，则助手可能如下所示：

public static float[] toFloats(Float[] floats) {
    float[] rv = new float[floats.length];
    for (int i=0; i < floats.length; i++) rv[i] = (float) floats[i];
    return rv;
}

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显然，您也可以修改helper函数来直接获取列表，从而避免调用

toArray（）

调用（这实际上是一个副本吗？）

我的建议是尽可能减少调用MATLAB Java桥的次数。例如，假设您从MATLAB循环中调用Java代码，而不是收集Java代码中的所有输出，然后从MATLAB中调用此方法。你能分享一些最简单的代码供我们测试吗（我知道Java代码是自动生成的）？这很好。使用这种方法，基准速度0.25现在已增加到6。这使得从Matlab调用javaapi成为迄今为止我尝试过的最快的方法。恐怕我没有足够的声望来支持这个答案。

public static float[] toFloats(Float[] floats) {
    float[] rv = new float[floats.length];
    for (int i=0; i < floats.length; i++) rv[i] = (float) floats[i];
    return rv;
}

some.package.toFloats(Q.toArray());