Linux AWK If/ElseConditional问题
我的数据如下所示:Linux AWK If/ElseConditional问题,linux,bash,unix,awk,Linux,Bash,Unix,Awk,我的数据如下所示: foo foo scaffold_7 1 4845 6422 4845 bar bar scaffold_7 -1 14689 16310 16310 我想做的是处理上面的行 我只想打印第1、2、3、7列,在第7列之后再打印一列。 但在打印第7列以后的内容时有条件 以下是我的awk脚本: awk '{ if ($4=="+") { {end=$6-$5}{print $1 "\t" $2 "\t" $3 "\t" $
foo foo scaffold_7 1 4845 6422 4845
bar bar scaffold_7 -1 14689 16310 16310
我想做的是处理上面的行
我只想打印第1、2、3、7列,在第7列之后再打印一列。
但在打印第7列以后的内容时有条件
以下是我的awk脚本:
awk '{
if ($4=="+") { {end=$6-$5}{print $1 "\t" $2 "\t" $3 "\t" $4 "\t" $7 "\t" end+$7} }
else
{end=$6-$5}{print $1 "\t" $2 "\t" $3 "\t" $4 "\t" $7-end "\t" $7}
}'
但为什么它不能达到这样的预期效果呢
foo foo scaffold_7 1 4845 6422
bar bar scaffold_7 -1 14689 16310
请注意,算术运算(例如$7-end
或end+$7
)是必须的。所以我们不能只交换列
从输入文件。此外,此AWK将位于bash脚本中。请尝试:
awk 'BEGIN {OFS = "\t"} {
end = $6 - $5
if ($4 >= 0) {
print $1, $2, $3, $4, $7, end + $7
} else {
print $1, $2, $3, $4, $7 - end, $7
}
}'
我从未在大括号中使用大括号,因此更喜欢使用分号分隔符。我非常确定else子句在您的示例中只绑定到{end=$6-$5}
,而不是绑定到两个带大括号的条目。在这种情况下,将对所有行执行{print$1”\t“$2”\t“$3”\t“$4”\t“$7-end”\t“$7}
。awk'{end=$6-$5}
$4>0{$0=$1“\t“$2”\t“$3”\t“$4”\t“$7”\t”end+$7}
$4更简洁、更短、更易于更改:awk-vOFS='\t'{…打印$1、$2…
awk '{end=$6-$5}
$4>0{ $0=$1 "\t" $2 "\t" $3 "\t" $4 "\t" $7 "\t" end+$7 }
$4<=0{$0=$1 "\t" $2 "\t" $3 "\t" $4 "\t" $7-end "\t" $7 }1' file