Linux 简单awk命令问题（FS、OFS相关）

我试图重新组织包含以下内容的文件格式：

>Humanl|chr16:86430087-86430726 | element 1 | positive
>Humanl|chr16:85620095-85621736 | element 2 | negative
>Humanl|chr16:80423343-80424652 | element 3 | negative
>Humanl|chr16:80372593-80373755 | element 4 | positive
>Humanl|chr16:79969907-79971297 | element 5 | negative
>Humanl|chr16:79949950-79951518 | element 6 | negative
>Humanl|chr16:79026563-79028162 | element 7 | negative
>Humanl|chr16:78933253-78934686 | element 9 | negative
>Humanl|chr16:78832182-78833595 | element 10 | negative

我的命令是：

awk '{FS="|";OFS="\t"} {print $1,$2,$3,$4,$5}'

以下是输出：

>Human|chr16:86430087-86430726  |      element 1      |
>Human  chr16:85620095-85621736         element 2      negative
>Human  chr16:80423343-80424652         element 3      negative
>Human  chr16:80372593-80373755         element 4      positive
>Human  chr16:79969907-79971297         element 5      negative
>Human  chr16:79949950-79951518         element 6      negative
>Human  chr16:79026563-79028162         element 7      negative
>Human  chr16:78933253-78934686         element 9      negative
>Human  chr16:78832182-78833595         element 10     negative

除第一行外，每一行都可以正常工作。我不明白为什么会这样

有人能帮我吗？谢谢

试试看：

awk 'BEGIN{FS="|";OFS="\t"} {print $1,$2,$3,$4,$5}'

简短回答

FS

和

OFS

设置得太晚，无法影响第一行，请改用类似的方式：

awk '{print $1,$2,$3,$4,$5}' FS='|' OFS='\t'

您也可以使用此较短版本：

awk -v FS='|' -v OFS='\t' '$1=$1'

回答再长一点 它不起作用，因为在设置

FS

和

OFS

时，awk已经执行了记录/字段拆分。您可以通过将

$0

设置为

$0

来强制重新拆分，例如：

awk '{FS="|";OFS="\t";$0=$0} {print $1,$2,$3,$4,$5}'

传统的方法是1。设置

FS

和

BEGIN

子句中的其他项，2。通过

-v VAR=VALUE

符号或3进行设置。将它们作为

VAR=VALUE

追加到脚本后面。我最喜欢的款式是最后一种：

awk '{print $1,$2,$3,$4,$5}' FS='|' OFS='\t'

---

请注意，设置

-v

和后期脚本变量之间存在显著差异

-v

将在

BEGIN

子句之前设置变量，而脚本后变量设置将在

BEGIN

子句之后设置。

感谢您的解释！你已经有了答案，但是考虑未来的问题，包括样本输入，当前和预期输出作为文本。