Loops 将多行awk命令放入for循环中而不打印变量

我有一个如下的命令，它根据IDs文件中的行，从过敏原文件中获取行

awk '
    FNR==NR{
    a[$1]
    next
    }
    /^Query/ || $2 in a
    ' IDs C100_Allergens | grep -B 1 'Hit: ' | grep -v '^--'  > C100_Allergens_matches.txt

但是，我有许多样本过敏原文件，并希望以循环方式运行它，其中列表是一个具有不同样本名称的文件：

for i in `cat list`
do
    awk '
    FNR==NR{
    a[$1]
    next
    }
    /^Query/ || $2 in a
    ' IDs "$i"_Allergens | grep -B 1 'Hit: ' | grep -v '^--'  > "$i"_Allergens_matches.txt
done

我尝试了这个循环，包括使用awk的变量标志，即-v I=“$I”：

---

我只会不断收到空文件。提前感谢您的帮助

从第一个文件中选择行的习惯用法是

FNR==NR

（F后面的no

=

）。您的awk脚本没有使用任何变量i，因此设置

-vi=

无效且无用。感谢@dave_thompson_085，这是一个拼写错误，现已修复，即FNR==nr在shell和awk代码中添加一些调试打印，以查看失败的地方。另请参阅，了解如何编写shell循环（假设您确实希望这样做）。无论它应该做什么，将awk输出管道化为2 greps和第二管道都是错误的方法。亲爱的@EdMorton，再次感谢您的指点。然而，陈述某事是一种“错误的方法”，而不是帮助寻求帮助的人是有点徒劳的。另一方面，感谢你对如何编写shell循环的见解。我不能告诉你做任何你想做的事情的正确方法，因为我不知道你想做什么。所以我有两个选择——1）让你知道这是一个糟糕的方法，这样你可以在提供更多信息后进行调查和/或提出问题；2）不让你知道这是一个糟糕的方法，所以你可以继续这样做。很遗憾听到做1是徒劳的。

for i in `cat list`
    do
        awk -v i="$i" '
        FNR==NR{
        a[$1]
        next
        }
        /^Query/ || $2 in a
        ' IDs "$i"_Allergens | grep -B 1 'Hit: ' | grep -v '^--'  > "$i"_Allergens_matches.txt
    done