Macos 为什么awk脚本不能在Mac OS上运行，但可以在Linux上运行？

我有这个awk脚本，我用它来过滤差异表达的基因。我有一个在R中创建的csv文件

 #Command to get DE genes
awk -F '\t' '$14 < 0.05 && $10 < -1 && $7 > 1 { print > "Genes-Down.csv" }
             $14 < 0.05 && $10 > +1 && $8 > 1 { print > "Genes-Up.csv" }' Results-RPKMs.csv

#获取DE基因的命令
awk-F'\t'$14<0.05&&10<-1&&7>1{print>“Genes Down.csv”}
$14<0.05&&$10>+1&&$8>1{print>“Genes Up.csv”}结果-RPKMs.csv

我现在开始在Mac OS上进行所有分析，但同样的命令不起作用。它也不会给出任何错误消息。它运行着，什么也没发生。我对其他sed命令也有同样的问题，但使用awk创建新命令很容易

---

更新： MacOS X awk的版本为20070501。然而，Ubuntu机器有mawk 1.3.3。命令awk--version无法工作。必须使用awk-W--版本。所以我认为这就是为什么它可以在Ubuntu上运行，但不能在MacOSX上运行。所以我下载了mawk并使用fink安装了它，现在这个命令在MacOSX中运行。谢谢你的帮助

---

更新2：实际上问题不是awk。通常我在R中创建csv文件，然后运行脚本进行过滤。结果表明，如果我在Excel中打开csv文件或以csv格式保存Excel文件，则脚本无法工作（使用不同的分隔符尝试了多次）。显然，如果您在MacOX（Excel 2011）中将电子表格另存为.csv，并尝试在Excel中打开它，则表明它是一个SYLK文件。Microsoft网站上有对此的描述。如果我使用OpenOffice，它工作得很好。

相同的命令名并不意味着它是相同的命令。大多数基本命令都有不同的实现，AWK就是一个例子，但几乎所有命令在BSD许可证中都有其等效的实现。您应该小心使用

gnused

和

bsdsed

，这也是一个陷阱

实际上，Linux通常使用

gawk

或

mawk

：

$ man awk
mawk - pattern scanning and text processing language

$ man awk
awk - pattern-directed scanning and processing language

Mac OS通常使用

nawk

：

$ man awk
mawk - pattern scanning and text processing language

$ man awk
awk - pattern-directed scanning and processing language

---

有关AWK实现的更多信息，请参阅。

我也遇到了同样的问题。通过在OSX 10.11.2上安装

gawk

，解决了我的问题

~$ brew install gawk
~$ gawk --version | head -n 1
GNU Awk 4.1.4, API: 1.1 (GNU MPFR 3.1.4-p1, GNU MP 6.1.1)
~$

---

尝试将

&

分组为

（$14<0.05&&10<-1）和&$7>1

cat-vet“Results-RPKMs.csv | head-10

。您是否在每行末尾看到

^M$

？如果是，则

dos2unix结果RPKMs.csv

。否则，请编辑您的问题，以包括来自两台机器的

awk--verion

结果。祝你好运。我刚刚在MacOS X上用

BSD awk

version 20070501试用了你的脚本，它与

mawk

和

gawk

一样工作顺利。仅供参考，mawk是一个功能最少的awk，经过精简后可以比其他awk运行得快一点。你最好安装功能丰富的POSIX超集gawk。对我来说也很有用。