Mapping 无参考基因组植物的定位和从头组装

嗨，我在研究一种没有参考基因组，只有一个支架组件和一个gff3注释文件的植物。我可以用相同的程序集和星形中的gff3创建索引并进行映射吗？如果我想使用Galaxy进行从头组装，我可以从样本的RNA序列中导入20个fastq文件的链接，以构建Trinity的参考基因组吗？如果这是可能的，请帮助我将这些文件的链接一起导入Galaxy并制作参考基因组

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非常感谢

这看起来像是一个问题。在堆栈溢出时，标记用于询问CPU执行的汇编语言/机器代码，而不是遗传序列的汇编。此外，标签是关于三星Galaxy手机的。我对生物信息学的了解还不够，无法判断这个问题是否有足够的细节，让熟悉你所谈论的事情的人来回答，但它的细节看起来很简单。我投票将这个问题作为离题来结束，因为它似乎是关于使用生物信息学工具，而不是编程本身。