Matplotlib提供了ValueError:当我再添加一个子批次时，图像大小像素太大
今天，我几乎整天都在努力解决图像大小的问题，当我尝试使用matplotlib add_subplot函数将多个绘图合并为一个图形时，像素太大了 我可以单独绘制每个图，但当我将它们组合在一起时，我会遇到这个问题。 下面是复制此值错误的简化代码Matplotlib提供了ValueError:当我再添加一个子批次时，图像大小像素太大,matplotlib,subplot,Matplotlib,Subplot,今天，我几乎整天都在努力解决图像大小的问题，当我尝试使用matplotlib add_subplot函数将多个绘图合并为一个图形时，像素太大了 我可以单独绘制每个图，但当我将它们组合在一起时，我会遇到这个问题。 下面是复制此值错误的简化代码 from matplotlib import pyplot as plt import numpy as np import os def plot_in_subplots(): fig= plt.figure(figsize=(15, 10))
from matplotlib import pyplot as plt
import numpy as np
import os
def plot_in_subplots():
fig= plt.figure(figsize=(15, 10))
axis1=fig.add_subplot(311)
# Uncomment line below to replicate ValueError: Image size of 3719x61904113 pixels is too large. It must be less than 2^16 in each direction.
# axis2=fig.add_subplot(312)
plot_bar_plot_in_given_axis(axis1)
# plot_in_given_axis(axis2)
figFile = os.path.join('/Users/burcakotlu/Desktop/Test_subplot.png')
fig.savefig(figFile, dpi=100, bbox_inches="tight")
plt.cla()
plt.close(fig)
def plot_in_given_axis(ax):
xticklabels_list = ['a','b','c','d','e','f'] * 6
rows=['row1']
ax.set_xlim([0, 36])
ax.set_xticklabels([])
ax.tick_params(axis='x', which='minor', length=0, labelsize=35)
ax.set_xticks(np.arange(0, 36, 1))
ax.set_xticks(np.arange(0, 36, 1) + 0.5, minor=True)
ax.set_xticklabels(xticklabels_list, minor=True)
ax.xaxis.set_label_position('top')
ax.xaxis.set_ticks_position('top')
plt.tick_params(
axis='x', # changes apply to the x-axis
which='major', # both major and minor ticks are affected
bottom=False, # ticks along the bottom edge are off
top=False) # labels along the bottom edge are off
ax.set_ylim([0, len(rows)])
ax.set_yticklabels([])
ax.tick_params(axis='y', which='minor', length=0, labelsize=40)
ax.set_yticks(np.arange(0, len(rows), 1))
ax.set_yticks(np.arange(0, len(rows), 1) + 0.5, minor=True)
ax.set_yticklabels(rows, minor=True) # fontsize
plt.tick_params(
axis='y', # changes apply to the x-axis
which='major', # both major and minor ticks are affected
left=False) # labels along the bottom edge are off
ax.grid(which='major', color='black', zorder=3)
def plot_bar_plot_in_given_axis(ax):
x_axis_labels = ['a', 'b', 'c', 'd', 'e', 'f']
real_values1 = [266655.0, 0.0, 14072.0, 4137.0, 6752.5, 0.0]
real_values2 = [273342.5, 0.0, 12598.5, 4240.0, 7425.5, 0.0]
unreal_values1 = [326188.16, 0.0, 15828.42, 4666.825000000001, 8109.87, 0.0]
unreal_values2 = [344462.07, 0.0, 16368.664999999999, 5180.2, 8721.64, 0.0]
q_values = [2.5309603790195403e-28, 1.0, 1.8194829804783173e-33, 0.003603381046779825, 1.0, 1.0]
name1 = 'X'
name2 = 'Y'
color1 = 'r'
color2 = 'b'
width = 0.1
ind = np.arange(len(x_axis_labels))
legend=None
rects3=None
rects4=None
rects1 = ax.bar(ind, real_values1, width=width, edgecolor='black', color=color1)
rects2 = ax.bar(ind + width, real_values2, width=width, edgecolor='black', color=color2)
if ((unreal_values1 is not None) and unreal_values1):
rects3 = ax.bar(ind+ 2*width, unreal_values1, width=width, edgecolor='black', color=color1, hatch = 'X')
if ((unreal_values2 is not None) and unreal_values2):
rects4 = ax.bar(ind +3*width, unreal_values2, width=width, edgecolor='black', color=color2, hatch = 'X')
ax.tick_params(axis='x', labelsize=35)
ax.tick_params(axis='y', labelsize=35)
locs, labels = plt.yticks()
ax.set_ylim(0, locs[-1] + 5000)
ax.set_title('%s vs. %s' %(name1,name2), fontsize=20,fontweight='bold')
ax.set_xticklabels(x_axis_labels, fontsize=35)
plt.ylabel('Y axis label', fontsize=35, fontweight='normal')
ax.set_xticks(ind + (3 * width) / 2)
realStrand1Name = 'Real %s' % (name1)
realStrand2Name = 'Real %s' % (name2)
simulationsStrand1Name = 'Unreal %s' % (name1)
simulationsStrand2Name = 'Unreal %s' % (name2)
if ((rects1 is not None) and (rects2 is not None) and (rects3 is not None) and (rects4 is not None)):
if ((len(rects1) > 0) and (len(rects2) > 0) and (len(rects3) > 0) and (len(rects4) > 0)):
legend = ax.legend((rects1[0], rects2[0], rects3[0], rects4[0]),
(realStrand1Name, realStrand2Name, simulationsStrand1Name, simulationsStrand2Name),prop={'size': 25}, ncol=1, loc='best')
ax.set_facecolor('white')
ax.spines["bottom"].set_color('black')
ax.spines["left"].set_color('black')
ax.spines["top"].set_color('black')
ax.spines["right"].set_color('black')
if (legend is not None):
frame = legend.get_frame()
frame.set_facecolor('white')
frame.set_edgecolor('black')
if q_values is not None:
for q_value, rect1, rect2 in zip(q_values,rects1,rects2):
# Get X and Y placement of label from rect.
y_value = max(rect1.get_height(),rect2.get_height())
x_value = rect1.get_x() + rect1.get_width()
space = 3
va = 'bottom'
if y_value < 0:
space *= -1
va = 'top'
if ((q_value is not None) and (q_value)<=0.05):
plt.annotate(
'***', # Use `label` as label
(x_value, y_value), # Place label at end of the bar
xytext=(0, space), # Vertically shift label by `space`
textcoords="offset points", # Interpret `xytext` as offset in points
ha='center', # Horizontally center label
va=va,
fontsize=20) # Vertically align label differently for
plot_in_subplots()
从matplotlib导入pyplot作为plt
将numpy作为np导入
导入操作系统
def plot_在_子图（）中：
图=plt.图（图尺寸=（15,10））
axis1=图添加_子批次（311）
#取消下面的行注释以复制ValueError：3719x61904113像素的图像大小太大。在每个方向上必须小于2^16。
#axis2=图添加_子批次（312）
在给定轴（轴1）中绘图
#在给定轴（轴2）中绘制
figFile=os.path.join（'/Users/burcakotlu/Desktop/Test_subplot.png'））
图savefig（figFile，dpi=100，bbox_英寸=“紧密”）
plt.cla（）
plt.关闭（图）
给定轴（ax）中的def绘图：
xticklabels_list=['a'、'b'、'c'、'd'、'e'、'f']*6
行=['row1']
ax.set_xlim（[0,36]）
ax.setxticklabels（[]）
ax.tick_参数（axis='x'，which='minor'，length=0，labelsize=35）
ax.set_xticks（np.arange（0,36,1））
ax.set_xticks（np.arange（0,36,1）+0.5，minor=True）
ax.set_xticklabels（xticklabels_列表，minor=True）
ax.xaxis.set_label_位置（'top'））
ax.xaxis.set_ticks_位置（'top'））
plt.tick_参数(
axis='x'，#更改适用于x轴
哪个=‘主要’，主要和次要蜱虫都会受到影响
底部=假，#沿底部边缘的勾号已禁用
顶部=假）#沿底部边缘的标签已关闭
ax.set_ylim（[0，len（行）]）
ax.设置标签（[]）
ax.勾选参数（轴为y'，其中为次轴，长度为0，标签大小为40）
ax.set_yticks（np.arange（0，len（行），1））
ax.set_yticks（np.arange（0，len（行），1）+0.5，minor=True）
ax.set#yticklabels（行，次=真）#fontsize
plt.tick_参数(
axis='y'，#更改适用于x轴
哪个=‘主要’，主要和次要蜱虫都会受到影响
左=假）#沿底部边缘的标签已关闭
ax.grid（哪个='major'，color='black'，zorder=3）
给定轴（ax）中的def绘图条绘图：
x_轴_标签=['a'、'b'、'c'、'd'、'e'、'f']
实际值1=[266655.0,0.0,14072.0,4137.0,6752.5,0.0]
实际_值2=[273342.5,0.0,12598.54240.0,7425.5,0.0]
非真实值1=[326188.16,0.0,15828.42,4666.825000000001,8109.87,0.0]
非真实值2=[344462.07,0.0,16368.66499999995180.28721.64,0.0]
q_值=[2.5309603790195403e-28,1.0,1.8194829804783173e-33,0.003603381046779825,1.0,1.0]
name1='X'
名称2='Y'
color1='r'
color2='b'
宽度=0.1
ind=np.arange（len（x_轴标签））
图例=无
rects3=无
rects4=无
rects1=最大条形（ind，实际值1，宽度=宽度，边颜色=黑色，颜色=颜色1）
rects2=最大条形（ind+宽度，实数值2，宽度=宽度，边颜色=黑色，颜色=颜色2）
如果（（非真实值1不是无）和非真实值1）：
rects3=ax.bar（ind+2*宽度，非真实值1，宽度=宽度，edgecolor='black'，color=color1，hatch='X'）
如果（（非真实值2不是无）和非真实值2）：
rects4=ax.bar（ind+3*width，unreal_值2，width=width，edgecolor='black'，color=color2，hatch='X'）
ax.勾选参数（轴=x'，标签大小=35）
ax.勾选参数（轴=y'，标签大小=35）
locs，labels=plt.yticks（）
最大设定值（0，位置[-1]+5000）
ax.set_title（“%s vs.%s%”（name1，name2），fontsize=20，fontwweight='bold'）
ax.设置x轴标签（x轴标签，fontsize=35）
plt.ylabel（'Y轴标签'，fontsize=35，fontweight='normal'）
最大设置宽度（ind+（3*宽度）/2）
RealStrandName='Real%s'（名称1）
realStrand2Name='Real%s'（名称2）
SimulationStrandName='不真实的%s'（名称1）
SimulationStrand2Name=“不真实的%s%”（名称2）
如果（（rects1不是无）和（rects2不是无）以及（rects3不是无）和（rects4不是无））：
如果（（len（rects1）>0）和（len（rects2）>0）和（len（rects3）>0）和（len（rects4）>0））：
legend=ax.legend（（rects1[0]、rects2[0]、rects3[0]、rects4[0]），
（RealStrandName，RealStrandName，SimulationStrandName，SimulationStrandName），prop={'size'：25}，ncol=1，loc='best'）
ax.set_facecolor（“白色”）
斧头刺[“底部”]。设置颜色（“黑色”）
斧头刺[“左”]。设置颜色（“黑色”）
斧头刺[“顶部”]。设置颜色（“黑色”）
斧头刺[“右”]。设置颜色（“黑色”）
如果（图例不是无）：
frame=legend.get_frame（）
frame.set_facecolor（“白色”）
框架设置颜色（“黑色”）
如果q_值不是无：
对于zip中的q_值、rect1、rect2（q_值、rects1、rects2）：
#从rect获取标签的X和Y位置。
y_值=最大值（rect1.get_height（），rect2.get_height（））
x_值=rect1.get_x（）+rect1.get_宽度（）
空间=3
va=‘底部’
如果y_值<0：
空格*=-1
va=‘顶级’
如果（（q_值不是None）和（q_值）我已经升级到Matplotlib 3.4.2。
我将plt.xxx改为ax.xxx（面向对象）并使用gridspec，我就快到了。谢谢
from matplotlib import pyplot as plt
from matplotlib import gridspec
import numpy as np
import os
def plot_in_subplots():
fig= plt.figure(figsize=(30, 10))
gs = gridspec.GridSpec(10, 4, width_ratios=[1,1,1,1], height_ratios=[1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1])
axis1 = plt.subplot(gs[0:7, 1:3])
axis2 = plt.subplot(gs[9, :])
# bottom_left_axis = plt.subplot(gs[-1,0])
# bottom_right_axis = plt.subplot(gs[-1,-1])
# axis1=fig.add_subplot(211)
# axis2=fig.add_subplot(212)
plot_bar_plot_in_given_axis(axis1)
plot_in_given_axis(axis2)
figFile = os.path.join('/Users/burcakotlu/Desktop/Test_subplot.png')
fig.savefig(figFile, dpi=100, bbox_inches="tight")
plt.cla()
plt.close(fig)
def plot_in_given_axis(ax):
xticklabels_list = ['a','b','c','d','e','f'] * 6
rows=['row1']
ax.set_xlim([0, 36])
ax.set_xticklabels([])
ax.tick_params(axis='x', which='minor', length=0, labelsize=35)
ax.set_xticks(np.arange(0, 36, 1))
ax.set_xticks(np.arange(0, 36, 1) + 0.5, minor=True)
ax.set_xticklabels(xticklabels_list, minor=True)
ax.xaxis.set_label_position('top')
ax.xaxis.set_ticks_position('top')
ax.tick_params(
axis='x', # changes apply to the x-axis
which='major', # both major and minor ticks are affected
bottom=False, # ticks along the bottom edge are off
top=False) # labels along the bottom edge are off
ax.set_ylim([0, len(rows)])
ax.set_yticklabels([])
ax.tick_params(axis='y', which='minor', length=0, labelsize=40)
ax.set_yticks(np.arange(0, len(rows), 1))
ax.set_yticks(np.arange(0, len(rows), 1) + 0.5, minor=True)
ax.set_yticklabels(rows, minor=True) # fontsize
ax.tick_params(
axis='y', # changes apply to the x-axis
which='major', # both major and minor ticks are affected
left=False) # labels along the bottom edge are off
ax.grid(which='major', color='black', zorder=3)
def plot_bar_plot_in_given_axis(ax):
x_axis_labels = ['a', 'b', 'c', 'd', 'e', 'f']
real_values1 = [266655.0, 0.0, 14072.0, 4137.0, 6752.5, 0.0]
real_values2 = [273342.5, 0.0, 12598.5, 4240.0, 7425.5, 0.0]
unreal_values1 = [326188.16, 0.0, 15828.42, 4666.825000000001, 8109.87, 0.0]
unreal_values2 = [344462.07, 0.0, 16368.664999999999, 5180.2, 8721.64, 0.0]
q_values = [2.5309603790195403e-28, 1.0, 1.8194829804783173e-33, 0.003603381046779825, 1.0, 1.0]
name1 = 'X'
name2 = 'Y'
color1 = 'r'
color2 = 'b'
width = 0.1
ind = np.arange(len(x_axis_labels))
legend=None
rects3=None
rects4=None
rects1 = ax.bar(ind, real_values1, width=width, edgecolor='black', color=color1)
rects2 = ax.bar(ind + width, real_values2, width=width, edgecolor='black', color=color2)
if ((unreal_values1 is not None) and unreal_values1):
rects3 = ax.bar(ind+ 2*width, unreal_values1, width=width, edgecolor='black', color=color1, hatch = 'X')
if ((unreal_values2 is not None) and unreal_values2):
rects4 = ax.bar(ind +3*width, unreal_values2, width=width, edgecolor='black', color=color2, hatch = 'X')
ax.tick_params(axis='x', labelsize=35)
ax.tick_params(axis='y', labelsize=35)
locs=ax.get_yticks()
ax.set_ylim(0, locs[-1] + 5000)
ax.set_title('%s vs. %s' %(name1,name2), fontsize=20,fontweight='bold')
ax.set_xticklabels(x_axis_labels, fontsize=35)
ax.set_ylabel('Y axis label', fontsize=35, fontweight='normal')
ax.set_xticks(ind + (3 * width) / 2)
realStrand1Name = 'Real %s' % (name1)
realStrand2Name = 'Real %s' % (name2)
simulationsStrand1Name = 'Unreal %s' % (name1)
simulationsStrand2Name = 'Unreal %s' % (name2)
if ((rects1 is not None) and (rects2 is not None) and (rects3 is not None) and (rects4 is not None)):
if ((len(rects1) > 0) and (len(rects2) > 0) and (len(rects3) > 0) and (len(rects4) > 0)):
legend = ax.legend((rects1[0], rects2[0], rects3[0], rects4[0]),
(realStrand1Name, realStrand2Name, simulationsStrand1Name, simulationsStrand2Name),prop={'size': 25}, ncol=1, loc='best')
ax.set_facecolor('white')
ax.spines["bottom"].set_color('black')
ax.spines["left"].set_color('black')
ax.spines["top"].set_color('black')
ax.spines["right"].set_color('black')
if (legend is not None):
frame = legend.get_frame()
frame.set_facecolor('white')
frame.set_edgecolor('black')
if q_values is not None:
for q_value, rect1, rect2 in zip(q_values,rects1,rects2):
# Get X and Y placement of label from rect.
y_value = max(rect1.get_height(),rect2.get_height())
x_value = rect1.get_x() + rect1.get_width()
space = 3
va = 'bottom'
if y_value < 0:
space *= -1
va = 'top'
if ((q_value is not None) and (q_value)<=0.05):
ax.annotate(
'***', # Use `label` as label
(x_value, y_value), # Place label at end of the bar
xytext=(0, space), # Vertically shift label by `space`
textcoords="offset points", # Interpret `xytext` as offset in points
ha='center', # Horizontally center label
va=va,
fontsize=20,
transform=ax.transAxes) # Vertically align label differently for
plot_in_subplots()
从matplotlib导入pyplot作为plt
从matplotlib导入gridspec
将numpy作为np导入
导入操作系统
def plot_在_子图（）中：
图=plt.图（图尺寸=（30,10））
gs=gridspec.gridspec（10,4，宽度比=[1,1,1,1]，高度比=[1,1,1,1,1,1,1]）
axis1=plt.子批次（gs[0:7,1:3]）
axis2=plt.子批次（gs[9，：]）
#底部\左\轴=plt.子批次（gs[-1,0]）
#底部\右\轴=plt.子批次（gs[-1，-1]）
#axis1=图添加_子批次（211）
#axis2=图add_子批次（212）
在给定轴（轴1）中绘图
在给定轴（轴2）中绘制
figFile=os.path.join（'/Users/burcakotlu/Desktop/Test_subplot.png'））
无花果