Parallel processing PBS，刷新标准输出

我有一个长期运行的Torque/PBS工作，我想监控输出。但日志文件只有在作业完成后才会被复制。有没有办法说服PBS刷新它？

不幸的是，AFAIK，这在PBS/Torque中是不可能的-stdout/stderr流在执行主机上本地假脱机，然后在作业完成后传输到提交主机。如果希望在执行过程中监视程序的标准输出，则可以将程序的标准输出重定向到文件（只有在执行和sumit主机共享一个公共文件系统时才有意义）

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我怀疑其基本原理是，它允许在与提交节点不共享文件系统的节点上执行作业。

这在TORQUE中是可能的。如果您有一个共享文件系统，您可以设置

$spool\u作为\u final\u name true

在妈妈的配置文件中。这将使文件直接写入最终输出目标，而不是在假脱机目录中进行假脱机。一旦设置好了，您就可以跟踪输出文件并监视任何您想要的内容

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（为我搜索spool\u作为\u final\u name

，通过ssh连接到作业运行的节点，查看

/var/spool/torque/spool/

下的文件，但它可能特定于此特定环境。

如果您提交一个shell脚本，您也可以将这两个命令放在脚本的开头

exec 1>file.stdout
exec 2>file.stderr

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这将把stdout和stderr的输出放在您的工作目录中。

我发现了一个

-k

标志，但它不是很好-因此我最终在队列外捕获了stdout。：/作为一个长期的SGE用户，习惯于能够立即看到输出文件，我确实感受到了您的痛苦。巧合的是，我在oon今天在MOAB/Torque系统上寻找LSF的

bpeek

命令的替代品，但令人沮丧的是没有找到。不，它不能由用户控制，但许多系统管理员也喜欢这个功能。为了让人们（像我一样）受益，寻找“我如何用它做这个？”的平台/频谱LSF模拟是。