如何使用Perl合并多个文件?

如何使用Perl合并多个文件?,perl,hash,Perl,Hash,我正在尝试将3个不同的文件合并到一个文件中。这些文件有3列,前2列在三个文件之间相同 文件(3列*263.900行): 为此,我使用一个Perl脚本来合并文件 当我合并两个文件(并创建一个包含4列的文件)时,该脚本可以工作,但如果我尝试添加一个,则无法工作 剧本: use strict; use warnings; # Variables my $file01 = "M8_S.dNdS.tsv" ; my $file02 = "M8_dN-dS.tsv"

我正在尝试将3个不同的文件合并到一个文件中。这些文件有3列,前2列在三个文件之间相同

文件(3列*263.900行):

为此,我使用一个Perl脚本来合并文件

当我合并两个文件(并创建一个包含4列的文件)时,该脚本可以工作,但如果我尝试添加一个,则无法工作

剧本:

use strict;
use warnings;

# Variables
my $file01 = "M8_S.dNdS.tsv" ;
my $file02 = "M8_dN-dS.tsv" ;
# Define hash
my %content02 = () ;
open (B, $file02) or die;
while (my $l1 = <B>) {
  $l1 =~ s/\n//g;
  $l1 =~ s/\r//g;
  my @cont_linea = split ("\t", $l1);
  my $valor_1 = $cont_linea[0];
  my $valor_2 = $cont_linea[1];
  my $valor_3 = $cont_linea[2];
  my $ids = "$valor_1\_$valor_2";
  $content02{$ids} = $valor_3;  ### <- STORE DATA IN HASH
}
close B;

#### Open second file
open (A, $file01) or die;
LOOPFILE:
while (my $l2 = <A>) {
  $l2 =~ s/\n//g;
  $l2 =~ s/\r//g;
  my @cont_linea_2 = split ("\t", $l2);
  my $valor_21 = $cont_linea_2[0];
  my $valor_22 = $cont_linea_2[1];
  my $valor_23 = $cont_linea_2[2];
  my $ids_2 = "$valor_21\_$valor_22";
  if (exists $content02{$ids_2}) {
    my $newval = $content02{$ids_2};
    print "$l2\t$newval\n";
    next LOOPFILE;
  }
}
close A;
exit;

我将加载抽象为一个子例程,这样代码就不会重复。$phase参数告诉它是否应该初始化散列、累加列,甚至打印结果。使用3个或更多文件

#/usr/bin/perl
严格使用;
使用警告;
使用特征qw{say};
次级负荷{
我的($file,$table,$phase)=@;
在“中打开我的$in,在shell中使用and而不是Perl:

paste file1.tsv <(cut -f3 file2.tsv) <(cut -f3 file3.tsv) > out.tsv

粘贴文件1.tsv谢谢!这看起来不错。但是,我只有一个问题,我想我必须在这行“ub load{my($file,$table,$phase)=@很抱歉问这个问题,我还是Perl的初学者。如前所述,脚本从命令行参数
@ARGV
中获取文件名。我知道了。感谢您的帮助,这项工作太棒了!
ID_1        ID_2        dN      dS      Omega 
QJY77946    NP_073551   0.0293  0.0757  0.3872
QJY77954    NP_073551   0.0273  0.0745  0.3668
QJY77954    QJY77946    0.0041  0.0085  0.4851
QJY77962    NP_073551   0.0273  0.0745  0.3668
QJY77962    QJY77946    0.0041  0.0109  0.3767 
...
paste file1.tsv <(cut -f3 file2.tsv) <(cut -f3 file3.tsv) > out.tsv