Php 如何将二进制编码为DNA序列

我想按照以下规则将二进制序列编码为DNA序列：

00 = A
01 = C
10 = G
11 = T

例如：

10011100

=

GCTA

我编写了一个PHP脚本，将字符串转换为二进制，然后使用

str\u replace

函数将二进制转换为DNA序列。我的问题是DNA序列没有正确转换。有人能帮我吗

以下是我的PHP脚本：

<?php
// Function to convert string to bin
function strToBin($input) {
    if (!is_string($input))
        return false;
    $ret = '';
    for ($i = 0; $i < strlen($input); $i++) {
        $temp = decbin(ord($input{$i}));
        $ret .= str_repeat('0', 8 - strlen($temp)) . $temp;
    }
    return $ret;
}
$bin = strToBin('Stack');
// Try to transcript binary to DNA
$bincomb = array('00', '01', '10', '11');
$DNAtrans = array('A', 'C', 'G', 'T');

echo $transcript = str_replace($bincomb, $DNAtrans, $bin);
?>

str_replace（）
方法不起作用，因为它按
00
、
01
、
10
、
11
的顺序查找子字符串。因此，例如，对于二进制字符串
1001
，它将内部
00
替换为
A
，之后字符串为
1A1
，并且不能再进行转换

要使函数正常工作，需要将二进制字符串分成两个字符的块

$bin = strToBin('Stack');

$bin = str_split($bin, 2);

$combine = array(
    '00' => 'A',
    '01' => 'C',
    '10' => 'G',
    '11' => 'T'
);

$str = '';

foreach ($bin as $item)
    $str .= $combine[$item];

首先将字符串拆分为两个字符块，然后循环使用，并将其各自的值附加到结果字符串
$str
中。在PHP中，我通常使用
strtr（）
的两个参数实现进行这些转换，如下所示：

//输出10011100
回波strtr（“GCTA”，数组（“A”=>“00”，“C”=>“01”，“G”=>“10”，“T”=>“11”）；

也可能出现相反的情况：

// outputs GCTA

回波strtr（“10011100”，数组（“00”=>“A”，“01”=>“C”，“10”=>“G”，“11”=>“T”）
 您好@Antti29，非常感谢您的帮助和解释。它工作得很好。