Python 3.x 修复将空列表指定给值“的错误”；DNA“U序列”；

所以，这个问题是上一篇文章的延续。从那时起，我就在PyCharm中编辑了脚本，现在这个脚本具有这样的外观：

import yaml
file = open('/home/ihor/Документи/біоінформатика/DNA_Sequence72 - Копія.py', 'r')
DNA = file.read()
DNA_Sequences = DNA.split(',')
Genetic_Codes = open('/home/ihor/Документи/біоінформатика/Genetic_Codes.py', 'r')
Genetic_Codes = Genetic_Codes.read()
Genetic_Codes_list = Genetic_Codes.split('\n')
for row in range(1152): #for str in list[Genetic_Codes_list] in range(1152):
    Alternative_Genetic_Codes = Genetic_Codes_list.pop(0)
    for line in range(1000):
        dna = DNA_Sequences.pop(0)
        codontable = yaml.load(Alternative_Genetic_Codes)
        codontable_sequence = ""
        for i in range(0, len(dna)-(3 + len(dna) % 3), 3):
            if codontable.get(dna[i:i + 3], codontable_sequence) == "_":
                break
            codontable_sequence += codontable.get(dna[i:i + 3], codontable_sequence)
        print(list([codontable_sequence]))

现在这个脚本只有一个错误：

索引器：从空列表中弹出

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在调试器中研究变量之后，我看到，

DNA\u Sequences=DNA.split（'，'）

行中的变量

DNA\u Sequences

被赋值为“[]（空列表）”。我的脚本将1000个DNA序列的字符串列表翻译成蛋白质，只需1个密码子表（字典），但我想要的是，这个脚本将1000个DNA序列的字符串列表翻译成蛋白质，每次运行1152个不同的密码子表。我读了很多关于这个错误的教程和其他资料，列表等等，但是我没有找到任何解决问题的方法。所有其他变量都完全正确。如何使用空列表修复此错误？我将非常感谢您的帮助。

您的代码毫无意义。尽管如此，答案还是要检查元素是否为空，如果是，则通过

for row in range(1152): #for str in list[Genetic_Codes_list] in range(1152):
    Alternative_Genetic_Codes = Genetic_Codes_list.pop(0)
    for line in range(1000):
        if len(DNA_Sequences) == 0:
            pass
        else:
            dna = DNA_Sequences.pop(0)
            codontable = yaml.load(Alternative_Genetic_Codes)
            codontable_sequence = ""
            for i in range(0, len(dna)-(3 + len(dna) % 3), 3):
                if codontable.get(dna[i:i + 3], codontable_sequence) == "_":
                    break
                codontable_sequence += codontable.get(dna[i:i + 3], codontable_sequence)
            print(list([codontable_sequence]))

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你真的应该使用biopython或类似的工具。

pop

从数组中删除项目，因此外部循环的第一次迭代会创建一个空数组。解决方案是按索引访问数组项，而不删除它们：

for line in range(1000):
    dna = DNA_Sequences[line]

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我由衷地感谢你的精彩提示！你救了我的生物信息学项目）成功了！