Python 3.x Unix或Python3。检索以“开始”开头的所有列；"；

我有一个6GB的文件，大约有1000行和4000000列。格式如下：

ID SEX PV APV N_rs1982983 E_rs1982983 N_rs95645 E_rs95645
1 0 45.2 11.1 0 2 0 1
2 1 34.4 10.8 1 1 1 1 

---

使用unix或Python3，我想检索所有以字符串“N_”开头的列。第3-4列有浮点数，其余列有整数。

400万列似乎很疯狂，但假设您有足够的可用内存，这个

perl

一行代码就可以了（对不起，我不懂python）：

$perl-lane'if（$.==1）{
$, = " ";
对于（0..$#F）{
如果$F[$\u]=~/^ N，则按@cols，$\u_/
}
}
打印@F[@cols]'input.txt
N_rs1982983 N_rs95645
0 0
1 1

---

基本上，由于

-a

的缘故，它将每一行拆分为空格上的列，如

awk

，并将其拆分为数组

@F

。在第一行，它构建了一个所有列的索引列表，以

N\uu

开头，并且只打印出所有行的那些列。

这些列是分开的还是空格？Hi@Shawn，spaceHi@Shawn，但是我可以将这个巨大的文件拆分为22个，保留每个行中的前4列（ID SEX PV APV）对于每个单独的文件都是相同的。