Python Numba,我该如何加速分析的NumPy代码矢量化?

Python Numba,我该如何加速分析的NumPy代码矢量化?,python,numpy,vectorization,mathematical-optimization,numba,Python,Numpy,Vectorization,Mathematical Optimization,Numba,我正在运行一个大型Python程序来优化金融领域(Markowitz)投资组合优化的投资组合权重。当我分析代码时,90%的运行时间用于计算投资组合回报,这是数百万次的。我能做些什么来加速我的代码?我试过: 向量化回报计算:使代码速度变慢,从1.5毫秒到3毫秒 使用来自Numba的函数autojit来加速代码:无更改 见下面的例子-有什么建议吗 import numpy as np def get_pf_returns(weights, asset_returns, horizon=60)

我正在运行一个大型Python程序来优化金融领域(Markowitz)投资组合优化的投资组合权重。当我分析代码时,90%的运行时间用于计算投资组合回报,这是数百万次的。我能做些什么来加速我的代码?我试过:

  • 向量化回报计算:使代码速度变慢,从1.5毫秒到3毫秒
  • 使用来自Numba的函数autojit来加速代码:无更改
见下面的例子-有什么建议吗

import numpy as np


def get_pf_returns(weights, asset_returns, horizon=60):
    '''
    Get portfolio returns: Calculates portfolio return for N simulations,
    assuming monthly rebalancing.

    Input
    -----
    weights: Portfolio weight for each asset
    asset_returns: Monthly returns for each asset, potentially many simulations
    horizon: 60 months (hard-coded)

    Returns
    -------
    Avg. annual portfolio return for each simulation at the end of 5 years
    '''
    pf = np.ones(asset_returns.shape[1])
    for t in np.arange(horizon):
        pf *= (1 + asset_returns[t, :, :].dot(weights))
    return pf ** (12.0 / horizon) - 1


def get_pf_returns2(weights, asset_returns):
    ''' Alternative '''
    return np.prod(1 + asset_returns.dot(weights), axis=0) ** (12.0 / 60) - 1

# Example
N, T, sims = 12, 60, 1000  # Settings
weights = np.random.rand(N)
weights *= 1 / np.sum(weights)  # Sample weights
asset_returns = np.random.randn(T, sims, N) / 100  # Sample returns

# Calculate portfolio risk/return
pf_returns = get_pf_returns(weights, asset_returns)
print np.mean(pf_returns), np.std(pf_returns)

# Timer
%timeit get_pf_returns(weights, asset_returns)
%timeit get_pf_returns2(weights, asset_returns)
编辑

解决方案:Matmul在我的机器上速度最快:

def get_pf_returns(weights, asset_returns):
    return np.prod(1 + np.matmul(asset_returns, weights), axis=0) ** (12.0 / 60) - 1

下面是一个使用
np.einsum
来获得一点加速的版本:

def get_pf_returns3(weights, asset_returns, horizon=60):
    pf = np.ones(asset_returns.shape[1])
    z = np.einsum("ijk,k -> ij",asset_returns[:horizon,:,:], weights)
    pf = np.multiply.reduce(1 + z)
    return pf ** (12.0 / horizon) - 1
然后是时间安排:

%timeit get_pf_returns(weights, asset_returns)
%timeit get_pf_returns3(weights, asset_returns)
print np.allclose(get_pf_returns(weights, asset_returns), get_pf_returns3(weights, asset_returns))

# 1000 loops, best of 3: 727 µs per loop
# 1000 loops, best of 3: 638 µs per loop
# True

机器上的计时可能会因硬件和numpy编译库的不同而有所不同

在我的环境中,
mutmul
@
)比
einsum
dot
具有适度的时间优势:

In [27]: np.allclose(np.einsum('ijk,k',asset_returns,weights),asset_returns@weig
    ...: hts)
Out[27]: True
In [28]: %timeit asset_returns@weights
100 loops, best of 3: 3.91 ms per loop
In [29]: %timeit np.einsum('ijk,k',asset_returns,weights)
100 loops, best of 3: 4.73 ms per loop
In [30]: %timeit np.dot(asset_returns,weights)
100 loops, best of 3: 6.8 ms per loop
我认为时间受到计算总数的限制,而不仅仅是编码细节。所有这些都将计算传递给编译后的numpy代码。您的原始循环版本相对较快,这一事实可能与少量循环(仅60个)以及更完整的
dot
中的内存管理问题有关

而且
numba
可能不会取代
dot
代码


因此,这里或那里的调整可能会将代码的速度提高2倍,但不要期望有一个数量级的改进。

谢谢!了解我能期望的是一个很大的帮助,然后我将查看代码的其余部分。