Python 从rpy2导入Robject时获取分段错误核心转储错误

手动安装R和rpy2

安装成功，但出现上述错误。请帮帮我

一些有用命令的输出：

>>> import rpy2
>>> rpy2.__path__
['/home/ashish/miniconda2/lib/python2.7/site-packages/rpy2-2.8.2-py2.7-linux-x86_64.egg/rpy2']
>>> import rpy2.robjects
cannot find system Renviron
/home/ashish/miniconda2/lib/python2.7/site-packages/rpy2-2.8.2-py2.7-linux- x86_64.egg/rpy2/rinterface/__init__.py:185: RRuntimeWarning: Fatal error: unable to open the base package


warnings.warn(x, RRuntimeWarning)
Segmentation fault (core dumped)

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提前感谢。

如果您通过conda安装rpy2，并且在同一台机器上安装了R系统（例如使用RStudio），则将使用系统的R安装。由于此R版本与rpy2需要的版本不匹配，因此会出现分段错误

1） 删除R（）的任何现有系统安装。确认您没有安装任何R：

$>which R
R not found

2） 在.rc文件中定义

R\u HOME

env变量：

export R_HOME=/Users/<your user>/anaconda3/envs/<env name>/lib/R

export R\u HOME=/Users//anaconda3/envs//lib/R

或者在python项目中动态地：

import os
os.environ['R_HOME'] = '/Users/<your user>/anaconda3/envs/<env name>/lib/R'

导入操作系统
os.environ['R_HOME']='/Users//anaconda3/envs//lib/R'

请包括重现错误的步骤。@cel更新了我的问题。请帮助我，感谢您的快速评论。“手动”或使用conda安装程序？手动@lgautierIt可能对您正在运行的R版本很重要。我注意到，至少在OSX的AnacondaRepos中，rpy2-2.8.2是针对R3.3.1构建的。分段错误可能是某种共享库版本不匹配。