Python 如何使子流程对象将输出保存到临时文件，然后从临时文件中获取值？

我目前正在Python代码中使用一个基于Unix的可执行文件来分析一些DNA序列。运行分析后，这个特定的可执行文件将输出写入一个文件，然后由我的代码读取该文件，并从中获取相关值

由于该文件除了产生一些值之外，不需要其他任何东西，因此我决定将其作为一个临时文件，在从中获取必要信息后将其删除。然而，我建立代码以实现这一点的努力被证明是徒劳的

import subprocess as sb
import tempfile

def calculate_complex_mfe(DNA_seq):
    complex_seq= str(DNA_seq)
    with tempfile.NamedTemporaryFile as mfefile:
        p= sb.Popen(['/Users/john/Documents/Biology/nupack3.0.6/bin/mfe', '-T', '41'], stdin=sb.PIPE, stdout=sb.PIPE, env=my_env)
        strb = (mfefile+'\n'+ complex_seq + '\n').encode('utf-8')
        data = p.communicate(input=strb)
        mfe= float(open(mfefile+'.mfe').readlines()[14])
    return mfe

我应该注意，strb变量的设置与运行可执行文件所需的格式相匹配。同样值得一提的是，我使用的功能正常的原始代码发布在下面

def calculate_complex_mfe(DNA_seq):
    complex_seq= str(DNA_seq)
    filename= "mfe-file"
    p= sb.Popen(['/Users/john/Documents/Biology/nupack3.0.6/bin/mfe', '-T', '41'], stdin=sb.PIPE, stdout=sb.PIPE, env=my_env)
    strb = (filename+'\n'+ complex_seq + '\n').encode('utf-8')
    data = p.communicate(input=strb)
    mfe= float(open(filename+'.mfe').readlines()[14])
    return mfe

---

有人能告诉我如何为可执行文件的输出创建一个临时文件，以便从中获得一些值吗？

来自文档：

NamedTemporaryFile（mode='w+b'，buffering=-1，encoding=None，newline=None，suffix=''，prefix='tmp'，dir=None，delete=True） 创建并返回一个临时文件

返回具有类似文件的接口的对象；文件名 可作为file.name访问。该文件将自动删除 关闭时，除非“delete”参数设置为False

您不需要写入文件句柄，只需要创建一个临时文件名，而不是打开一个临时文件。只需替换：

filename= "mfe-file"

借

在第二个代码段中，为您生成临时文件名（完整路径）

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不要忘了

os。完成后删除（文件名）

它。

谢谢你的提示！但是该代码不会运行，因为行

os.remove（filename）

产生一个错误

没有这样的文件或目录

。我试图用一个表示文件存储路径的变量替换

filename

，但它仍然不起作用。我怎样才能改善它呢？好吧，我现在开始工作了。。。我必须添加

filename=tempfile.mktemp（dir=current_directory）

，还要添加

os.remove（filename+'.mfe'）

，以便让代码最终正常工作。

filename = tempfile.mktemp()