Python 替换两个csv文件中的值

我有一个小问题，我希望你能帮我：）我试着提供一些简单的例子来帮助你理解我的意思。我正在使用python 2.6

因此，我目前正在尝试在一个文件中重新分配一些值，该文件表示两个对象之间的交互。交互文件（file1）如下所示：

Thing1  Thing2  0.625
Thing2  Thing3  0.191
Thing1  Thing3  0.173

而我的另一个文件（file2），也是一个

tsv

，看起来像：

DiffName1  Thing1  ...
DiffName2  Thing2  ...
DiffName3  Thing3  ...

基本上，我希望获取

file1

，在file2中找到相应的

'DiffName'

值，并创建一个与file1布局相同的新文件，但将'Thing1'替换为'DiffName1'等等，同时保持

file1

的结构。i、 e具有相应交互值的两列

到目前为止，通过在这里提问和阅读答案，我已经用这个脚本获得了类似的结果：（我已经检查过了，但这里可能有一些多余/错误的东西）

但无论出于何种原因，我怀疑由于

file2

的布局与最初编写此脚本的文件略有不同，我一直无法让它为我工作。我花了相当多的时间试图理解这个文件的每一行，但我仍然不能让它运行，可能是因为我没有完全理解最后一行：

csv_output.writerow([ids.get(cols[0], cols[0]), ids.get(cols[1], cols[1]), cols[2]]) 

有人能给我一些建议吗

干杯

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Matthew

在那行

ids[cols[7]]=cols[0]

只是一个输入错误，您的示例中似乎只有2列，并且您正在尝试使用第7列

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它的作用是声明一个字典并从第二个文件填充它。然后，当您使用get

ids.get（cols[0]，cols[0]）

在字典中搜索时，它将搜索一个键

cols[0]

，如果它不在字典中，它将返回get函数的第二个参数，在本例中是

cols[0]

本身。

我在脚本中添加了一些注释，并更改/缩短了一些位。应帮助您理解最后一行：

import csv, sys

interaction_file, out_file = sys.argv[1], sys.argv[2]
f_output = open(out_file, 'wb')          

with open('file2') as f_file2:
    # get lines as list and slice off header row
    rows = list(csv.reader(f_file2, skipinitialspace=True, delimiter='\t'))[1:]  

    # ids: Thing* as key, DiffName* as value
    ids = {row[1]: row[0] for row in rows}

with open(interaction_file, 'rb') as f_file1:       
    csv_file1 = csv.reader(f_file1, delimiter='\t')     
    csv_output = csv.writer(f_output, delimiter='\t')   

    for row in csv_file1:   
        csv_output.writerow([ids.get(row[0], row[0]), ids.get(row[1], row[1]), row[2]])
        # ids.get(row[0], row[0]): dict.get(key[, default])
        # use value (DiffName*) for key row[0] (Thing*) from ids,
        # or use row[0] (Thing*) itself
        # if it is not present as a key in ids

---

检查输入文件是否有正确的分隔符。看到错误信息也很好。

您有使用熊猫的自由吗？如果是这样，请尝试使用pandas join或str.replace函数，它到底如何不适用于您？我只是询问，您是否有使用pandas的自由。不幸的是，我的脚本主要运行在服务器上，我没有根访问权限，因此我宁愿不使用pandasys，这是一个输入错误，我道歉。它是从我有一个类似的任务，但想在我的文件2的位置7的值，并改变它在字典的位置1留下的。至少这是我对这句话的理解。非常感谢你的帮助，你的评论确实帮助我更好地理解了这句话。但是，这个脚本不会改变我的文件。我在最后一行中改变了索引位置，试图了解出了什么问题，但没有任何东西影响输出。（输出看起来与交互文件相同）那么，您应该在其中放入一些调试

print

语句，以查看正在处理的实际行、键和值。否则很难从远处诊断；）

对于行中的行：ids={row[1]：row[0]}print ids

生成一个字典，该字典按预期表示

Name:DiffName

。我不明白的是，如果我更改最后一行中的索引位置，为什么在我的输出中没有表示出来。在最后一个循环中，

print row

的输出是什么？它打印输入文件中的行的精确副本。

import csv, sys

interaction_file, out_file = sys.argv[1], sys.argv[2]
f_output = open(out_file, 'wb')          

with open('file2') as f_file2:
    # get lines as list and slice off header row
    rows = list(csv.reader(f_file2, skipinitialspace=True, delimiter='\t'))[1:]  

    # ids: Thing* as key, DiffName* as value
    ids = {row[1]: row[0] for row in rows}

with open(interaction_file, 'rb') as f_file1:       
    csv_file1 = csv.reader(f_file1, delimiter='\t')     
    csv_output = csv.writer(f_output, delimiter='\t')   

    for row in csv_file1:   
        csv_output.writerow([ids.get(row[0], row[0]), ids.get(row[1], row[1]), row[2]])
        # ids.get(row[0], row[0]): dict.get(key[, default])
        # use value (DiffName*) for key row[0] (Thing*) from ids,
        # or use row[0] (Thing*) itself
        # if it is not present as a key in ids