Python 尝试在SQLite中按组合主键的长列表选择行

这是我在浏览本网站时发现的代码查询：

query="""SELECT Family
           FROM Table2
     INNER JOIN Table1 ON Table1.idSequence=Table2.idSequence
     WHERE (Table1.Chromosome, Table1.hg19_coordinate) IN ({seq})
""".format(seq=','.join(['?']*len(matchIds_list)))

matchIds_list是一个元组列表，位于？，？格式

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如果我只要求一个条件，也就是表1，它就可以工作。相对于Chrome和hg_坐标，MatchId_列表只是一个简单的单值列表，但我不知道如何让它与复合键或两列一起工作。

因为您运行的是SQLite 3.7.17，我建议只使用一个临时表

cursor.executescript("""
    CREATE TEMP TABLE control_list (
        Chromosome TEXT NOT NULL,
        hg19_coordinate TEXT NOT NULL
    );

    CREATE INDEX control_list_idx ON control_list (Chromosome, hg19_coordinate);
""")

cursor.executemany("""
    INSERT INTO control_list (Chromosome, hg19_coordinate)
    VALUES (?, ?)
""", matchIds_list)

创建并填充临时表

cursor.executescript("""
    CREATE TEMP TABLE control_list (
        Chromosome TEXT NOT NULL,
        hg19_coordinate TEXT NOT NULL
    );

    CREATE INDEX control_list_idx ON control_list (Chromosome, hg19_coordinate);
""")

cursor.executemany("""
    INSERT INTO control_list (Chromosome, hg19_coordinate)
    VALUES (?, ?)
""", matchIds_list)

只需将查询约束到控制列表临时表

cursor.executescript("""
    CREATE TEMP TABLE control_list (
        Chromosome TEXT NOT NULL,
        hg19_coordinate TEXT NOT NULL
    );

    CREATE INDEX control_list_idx ON control_list (Chromosome, hg19_coordinate);
""")

cursor.executemany("""
    INSERT INTO control_list (Chromosome, hg19_coordinate)
    VALUES (?, ?)
""", matchIds_list)

选择族 来自表2 内连接表1 在Table1.idSequence=Table2.idSequence上 -约束到控制列表。 哪里有 挑选* 从控制列表 其中control_list.chromose=表1.chromose 和控制列表.hg19\u坐标=表1.hg19\u坐标 最后执行查询，不需要格式化这个查询

cursor.execute(query)

# Remove the temporary table since we're done with it.
cursor.execute("""
    DROP TABLE control_list;
""")

短查询需要SQLite 3.15：实际上您几乎已经拥有了它。您需要在{seq}中创建子查询 表情

选择族 来自表2 内连接表1 在Table1.idSequence=Table2.idSequence上 其中表1.染色体，表1.hg19_坐标值{seq}； 长查询需要SQLite 3.8.3：它看起来有点复杂，但非常简单。把你的 控件列表转换为子选择，然后通过控件约束该主选择 名单

选择族 来自表2 内连接表1 在Table1.idSequence=Table2.idSequence上 -约束到控制列表。 哪里有 挑选* 从…起 选择 -名称列必须与元组中的顺序匹配。 作为染色体， ：1作为hg19_坐标 从…起 -获取控制列表。 值{seq} 作为控制值 作为控制列表 -将表1约束到控制列表。 其中control_list.chromose=表1.chromose 和控制列表.hg19\u坐标=表1.hg19\u坐标 无论使用哪种查询，在格式化SQL时，将{seq}替换为？，？对于每个compsite 钥匙而不是仅仅

最后在执行查询时展平MatchID_列表，因为它是元组列表

import itertools
cursor.execute(query, list(itertools.chain.from_iterable(matchIds_list)))

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谢谢你的快速回复！我试图测试一个更简单的查询，但不明白为什么连这个都不起作用sqlite>SELECT Family FROM Table2 INNER JOIN Table1 ON Table1.idSequence=Table2.idSequence其中Table1.chrome，Table1.hg19_坐标在'1'，'102568923'，'1'，'12333567'；我尝试了您提供的代码，但它给了我一个错误：回溯最近的调用last:File/home/nchuang/MyTools/test\u database/test\u database.py，第183行，在c.executequery中，listitertools.chain.from\u iterablematchIds\u list sqlite3.OperationalError:near VALUES:syntax error。刚刚看到你的编辑。我会检查的。我尝试了长查询和短查询。对于我的简短查询，我还更新了我的联接以包括“？，？”？，？并将列表展平。它给了我一个sqlite3.ERROR:near，：语法error@nchuang你知道你正在运行哪个版本的SQLite吗？您可以使用SELECT sqlite_version查询它。我使用的sqlite3库是3.7.17。顺便说一句，添加值使我的第一条评论生效！所以你给我的简短询问肯定有用。我不明白这里有什么不同。不鼓励像这样构建SQL。他在用什么？用于参数化查询的。这是正确的方法。