Python scipy.ndimage.generic_筛选器返回类型错误
我正在使用Python scipy.ndimage.generic_筛选器返回类型错误,python,numpy,scipy,ndimage,Python,Numpy,Scipy,Ndimage,我正在使用scipy.ndimage.generic_过滤器计算数组的局部模态值。我比较了两种方法,看哪一种更快(因为第一种方法非常慢)。我的第一个方法是 import numpy as np import scipy.stats as stats import scipy.ndimage def modal(arr): return stats.mode(arr, axis=None)[0][0] x = np.random.randint(0, 100, size=(10, 10
scipy.ndimage.generic_过滤器
计算数组的局部模态值。我比较了两种方法,看哪一种更快(因为第一种方法非常慢)。我的第一个方法是
import numpy as np
import scipy.stats as stats
import scipy.ndimage
def modal(arr):
return stats.mode(arr, axis=None)[0][0]
x = np.random.randint(0, 100, size=(10, 10))
scipy.ndimage.filters.generic_filter(x, modal, size=3)
def modal(arr):
return np.argmax(np.bincount(arr.flatten()))
x = np.random.randint(0, 100, size=(10, 10))
scipy.ndimage.filters.generic_filter(x, modal, size=3)
我的第二种方法是
import numpy as np
import scipy.stats as stats
import scipy.ndimage
def modal(arr):
return stats.mode(arr, axis=None)[0][0]
x = np.random.randint(0, 100, size=(10, 10))
scipy.ndimage.filters.generic_filter(x, modal, size=3)
def modal(arr):
return np.argmax(np.bincount(arr.flatten()))
x = np.random.randint(0, 100, size=(10, 10))
scipy.ndimage.filters.generic_filter(x, modal, size=3)
但通过第二种方法,我得到了:
TypeError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-122-2e9030c57d71> in <module>()
1 #%timeit -n 5 -r 1
----> 2 scipy.ndimage.filters.generic_filter(x, modal, size=3)
C:\Python27\ArcGIS10.2\lib\site-packages\scipy\ndimage\filters.pyc in generic_filter(input, function, size, footprint, output, mode, cval, origin, extra_arguments, extra_keywords)
1161 mode = _ni_support._extend_mode_to_code(mode)
1162 _nd_image.generic_filter(input, function, footprint, output, mode,
-> 1163 cval, origins, extra_arguments, extra_keywords)
1164 return return_value
<ipython-input-118-86ea9b03ed30> in modal(arr)
1 def modal(arr):
----> 2 return np.argmax(np.bincount(arr.flatten()))
3 return stats.mode(arr, axis=None)[0][0]
TypeError: array cannot be safely cast to required type
它返回True
当返回值相同时,为什么使用numpy.bincount
方法时generic\u过滤器
抛出类型错误,而不是stats.mode
方法
我在Windows 7上使用Python 2.7.3、Numpy 1.6.1和Scipy 0.14.0(我坚持使用此版本的Numpy和Python,因为这是ESRI ArcGIS附带的)。我尝试安装scikit image来计算模式过滤器,但在安装过程中出现了其他错误,我认为解决这个问题更简单 您可以通过在
模式中放置print语句来调查此错误:
def modal(arr):
print(arr)
return np.argmax(np.bincount(arr.flatten()))
您将看到如下输出
[ 92. 92. 31. 92. 92. 31. 87. 87. 18.]
这表明arr
包含浮点数,而不是整数。np.bincount
的文档说明其第一个参数必须是非负整数的一维数组
因此,您可以通过使用astype('int64')
将浮点转换为int来避免错误
import numpy as np
import scipy.stats as stats
import scipy.ndimage
def modal(arr):
return stats.mode(arr, axis=None)[0][0]
def modal2(arr):
count = np.bincount(arr.astype('int64'))
return np.argmax(count)
x = np.random.randint(0, 100, size=(10, 10))
out = np.empty_like(x, dtype='float')
scipy.ndimage.filters.generic_filter(x, modal, size=3, output=out)
print(out)
scipy.ndimage.filters.generic_filter(x, modal2, size=3, output=out)
print(out)
PS.plant
调用可以删除,因为arr
已经是一维的