Python-在空间中叠加多个点

在我当前的任务中，我在空间中有四个笛卡尔坐标系的参考点（特别是原子），然后还有一组四个坐标系的原子群。我想做的是将每个群与参考群相匹配，然后得到原子坐标的变化。每个群中原子之间的关系不能改变，我想把它当作一个整体来看待，只是想找到最好的方法使它适合参考群

我想知道是否有什么好方法可以在Python中实现这一点，而不用编写自己的模块

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非常感谢您的帮助。

这是2D还是3D？您已经开始考虑了吗？如果三维空间中有四个参照点，则可以使用阵列（x、y、z）定义每个参照点。你是什么意思？将每个组与参考组匹配，然后获得原子的变化坐标？这听起来像是阵列的加减法？这是在3D中，我将每个点定义为一个XYZ，我想要一个干净的方法将一组4个原子叠加到一个参考组上。这并不像减法数组那么简单，因为我不能假设，一个群中每个原子之间的距离都和参比原子相同。