Python 熊猫连续数据的平行坐标图

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pandas的平行_坐标函数非常有用:

import pandas
import matplotlib.pyplot as plt
from pandas.tools.plotting import parallel_coordinates
sampdata = read_csv('/usr/local/lib/python3.3/dist-packages/pandas/tests/data/iris.csv')
parallel_coordinates(sampdata, 'Name')

但是,当您拥有连续的数据时,它的行为并不是您所期望的:

mypos = np.random.randint(10, size=(100, 2))
mydata = DataFrame(mypos, columns=['x', 'y'])
myres = np.random.rand(100, 1)
mydata['res'] = myres
parallel_coordinates(mydata, 'res')

我想用线条的颜色来反映震级 对于连续变量,例如,在从白色到黑色的梯度中, 最好还具有一定的透明度(α值),
旁边有一个颜色条。

我今天也遇到了同样的问题。我的解决方案是复制熊猫的平行_坐标,并根据我的特殊需要进行调整。由于我认为它对其他人有用,以下是我的实现:

def parallel_coordinates(frame, class_column, cols=None, ax=None, color=None,
                     use_columns=False, xticks=None, colormap=None,
                     **kwds):
    import matplotlib.pyplot as plt
    import matplotlib as mpl

    n = len(frame)
    class_col = frame[class_column]
    class_min = np.amin(class_col)
    class_max = np.amax(class_col)

    if cols is None:
        df = frame.drop(class_column, axis=1)
    else:
        df = frame[cols]

    used_legends = set([])

    ncols = len(df.columns)

    # determine values to use for xticks
    if use_columns is True:
        if not np.all(np.isreal(list(df.columns))):
            raise ValueError('Columns must be numeric to be used as xticks')
        x = df.columns
    elif xticks is not None:
        if not np.all(np.isreal(xticks)):
            raise ValueError('xticks specified must be numeric')
        elif len(xticks) != ncols:
            raise ValueError('Length of xticks must match number of columns')
        x = xticks
    else:
        x = range(ncols)

    fig = plt.figure()
    ax = plt.gca()

    Colorm = plt.get_cmap(colormap)

    for i in range(n):
        y = df.iloc[i].values
        kls = class_col.iat[i]
        ax.plot(x, y, color=Colorm((kls - class_min)/(class_max-class_min)), **kwds)

    for i in x:
        ax.axvline(i, linewidth=1, color='black')

    ax.set_xticks(x)
    ax.set_xticklabels(df.columns)
    ax.set_xlim(x[0], x[-1])
    ax.legend(loc='upper right')
    ax.grid()

    bounds = np.linspace(class_min,class_max,10)
    cax,_ = mpl.colorbar.make_axes(ax)
    cb = mpl.colorbar.ColorbarBase(cax, cmap=Colorm, spacing='proportional', ticks=bounds, boundaries=bounds, format='%.2f')

    return fig
我不知道它是否能适用于pandas原始功能提供的每个选项。但就你的例子来说,它给出了如下内容:

parallel_coordinates(mydata, 'res', colormap="binary")

可以通过在上一个函数中更改此行来添加alpha值:

ax.plot(x, y, color=Colorm((kls - class_min)/(class_max-class_min)), alpha=(kls - class_min)/(class_max-class_min), **kwds)
例如,删除名称并使用最后一列作为值:

sampdata = read_csv('iris_modified.csv')
parallel_coordinates(sampdata, 'Value')

我希望这对你有帮助


Christophe

您好,我似乎没有iris(或iris.csv)模板文件,这是理解如何构造数据以创建平行坐标图所需的。有人能帮我上传吗?谢谢你的提示,我试过了,效果很好!如何为每个轴设置单独的值比例(y范围)?换言之,想象一下:色阶在1到8色阶之间变化,宽度在20到100花瓣之间,色阶在0到1之间,谢谢!