关于使用MDAPackmol（python中的packmol）的问题

我想在我的研究中使用python包装器for packmol（MDAPackmol）。为了做到这一点，我尝试使用上提供的示例代码和pdb文件，以便了解如何使用包装器。但是，当我运行代码时，我收到以下错误消息：

ValueError:invalid literal for int（），以10为基数

以下是完整的追溯：


该错误源于长度为零的字符串
start.resname
。这似乎是resname有数字和字母的问题，因此是
Universe
的问题（由
load\u packmol\u output返回的对象
）。因此，残留物存在问题。我现在想知道这是下载/安装MDAnalysis的错误还是缺少依赖项。如有任何建议或见解，将不胜感激。谢谢
 我真的无法重现您的错误，但让我们从stacktrace反向工作


我们在184号线上。失败的部分是
int（start.resname[1:]）
。如果我运行示例代码，那么
start.resname
等于
R0
，因此
start.resname[1:
是
'0'
和
int（start.resname[1:]）
是
0


在您的情况下，
start.resname
可能类似于
R
，因此
start.resname[1:
是
'
，而
int（start.resname[1:]）
则会因
ValueError
而失败

stacktrace的其余部分没有提供足够的信息来推断
start.resname
没有所需格式的原因。但是，请尝试在具有调试支持的编辑器中运行代码（如我在上面的屏幕截图中所做的），添加足够多的断点，并尝试逐步检查代码和MDAPackmolCode，直到找到出错的地方
我无法真正重现您的错误，但让我们从stacktrace开始反向工作


我们在184号线上。失败的部分是
int（start.resname[1:]）
。如果我运行示例代码，那么
start.resname
等于
R0
，因此
start.resname[1:
是
'0'
和
int（start.resname[1:]）
是
0


在您的情况下，
start.resname
可能类似于
R
，因此
start.resname[1:
是
'
，而
int（start.resname[1:]）
则会因
ValueError
而失败

stacktrace的其余部分没有提供足够的信息来推断
start.resname
没有所需格式的原因。但是，尝试在具有调试支持的编辑器中运行代码（如我在上面的屏幕截图中所做的那样），添加足够多的断点，并尝试逐步检查代码和MDAPackmolCode，直到找到错误所在
您是否可以用错误的完整堆栈跟踪更新您的问题。我无法重现你的错误。为了确保，您使用的是
['inbox0.0.0.40.40.']
作为说明（在
列表中的
str
），而不是您发布的内容，对吗？谢谢您的评论。是的，这就是我正在使用的。抱歉输入错误。你能用你的错误的完整跟踪更新你的问题吗。我无法重现你的错误。为了确保，您使用的是
['inbox0.0.0.40.40.']
作为说明（在
列表中的
str
），而不是您发布的内容，对吗？谢谢您的评论。是的，这就是我正在使用的。抱歉打错了。非常感谢！我会试试你的建议。很高兴包装器能起作用：这真的能帮到我的小组。非常感谢！我会试试你的建议。很高兴包装器可以工作：这将真正帮助我的团队。