Python 具有matplotlib和networkx的交互式图形

我的问题如下：

我想用networkx和matplotlib绘制一个图形。当显示图形时，我的程序应该处理一些其他的东西。因此我提出了

matplotlib.pyplot.ion（）

函数来允许交互模式

我的代码：

def print_graph(graph):
    """ prints the graph"""

    # stores the nodes and their name attributes in a dictionary
    nodes_names = nx.get_node_attributes(graph, "name")
    plt.ion()
    pos = nx.spring_layout(graph)

    # draw without labels, cuz it would label them with their adress, since we
    nx.draw(graph, pos, with_labels=False)

    # draw the label with the nodes_names containing the name attribute
    labels = nx.draw_networkx_labels(graph, pos, nodes_names)
    plt.show()

def setup_sending(graph, iteration):
"""method which handles sending messages in the network,
only call it once for sending sweet packages in a network"""
    print_graph(graph)

    ###some code doing calculations....

    raw_input('Press enter to continue')    

运行此功能实际上不起作用。Wll，它完成所有计算，甚至打开一个图形窗口。但是这个窗口应该显示图形正在处理某些东西，并且保持白色。按Enter键后退出程序

那么，有人知道如何让代码显示图形吗

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编辑

 def setup_graph(laplacian):
""" this fucntion creates a graph object with the nodes and its edges
already correct initialized"""
    # this block adds the nodes to the graph and creates two dict
    # in order to label the graph correctly
    size = len(laplacian[0, :])
    my_graph = nx.Graph()
    for i in range(size):
        my_graph.add_node(Node(), name=str(i + 1))
    print(my_graph.nodes())
    # stores the nodes and their name attributes in a dictionary
    nodes_names = nx.get_node_attributes(my_graph, "name")
    # switches key and values--> thus names_nodes
    names_nodes = dict(zip(nodes_names.values(), nodes_names.keys()))

    # this block adds the edges between the nodes
    for i in range(0, size):
        for j in range(i + 1, size):
            if laplacian[i, j] == -1:
                node_1 = names_nodes[str(i + 1)]
                node_2 = names_nodes[str(j + 1)]
                my_graph.add_edge(node_1, node_2)

    return my_graph

Node（）

只是一个包含特定列表的对象

这对我很有用：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

def print_graph(graph):
    """ prints the graph"""

    # stores the nodes and their name attributes in a dictionary
    nodes_names = nx.get_node_attributes(graph, "name")
    plt.ion()
    pos = nx.spring_layout(graph)

    # draw without labels, cuz it would label them with their adress, since we
    nx.draw(graph, pos, with_labels=False)

    # draw the label with the nodes_names containing the name attribute
    labels = nx.draw_networkx_labels(graph, pos, nodes_names)
    plt.show()

def setup_sending(graph):
    print_graph(graph)

    ###some code doing calculations....

    raw_input('Press enter to continue')

def main():
    G=nx.dodecahedral_graph()
    setup_sending(G)

if __name__ == '__main__':
    main()

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所以，我认为你的问题可能是你的图表的大小。它有多大？它有多少个节点/边？

它有6个节点。所以它不是太大。我不确定，但我认为代码中添加边的部分不正确。您一直试图通过名称而不是对象来添加边。因此，假设有两个节点：（a，name=“foo”）和（b，name=“bar”）。如果您在“foo”和“bar”之间添加一条边，那么您不是在连接“a”和“b”，而是在连接其他两个名为“foo”和“bar”的新节点。我认为最好的办法是在Node（）对象中添加getter方法。为了确保这是真正的问题，如果在

print\u graph（graph）

方法中打印图形，会发生什么情况？我的意思是，尝试这样做：

print str（graph.edges（））

比较

print（my\u graph.nodes（））

和

print（my\u graph.edges（））

似乎节点对象是正确的。但是我不是100%肯定，因为我在python方面没有太多经验。但据我所知，赋值

node\u 1=names\u nodes[str（I+1）]

从字典中检索node对象，并使node\u 1指向同一个node-object。因此，

print str（graph.edges（））

在

print\u graph（graph）

中输出正确的图形，对吗？如果是，请将您的输出粘贴到此处。[，，，]