Python 我的输出文件中的数据没有'；t打印它应有的所有结果

我正在尝试将makeList[start]的索引输出到makeList[end]。我有所有正确的起始值和结束值，总共大约11对。但是，我没有得到正确的输出，因为它没有打印出所有可能的输出。为什么会这样

def searchPFAM(fname):
   with open(fname,'rb') as f:
       root = etree.parse(f)
       for lcn in root.xpath("/protein/match[@dbname='PFAM']/lcn"):
          try:
             start = int(lcn.get("start"))
             end = int(lcn.get("end"))
             yield start, end
          except (TypeError , ValueError) as e:
             pass 

uniprotID ='Q14591'

def createRef():
    fileInput = open(uniprotID +'.txt','r')
    readAA = fileInput.read()
    store_value = (readAA.partition('\n'))
    aaSequence = store_value[2].replace('\n', '')
    makeList = list(aaSequence)
    return makeList

makeList = createRef()

for start, end in searchPFAM(fname):
    print start, end  
    if start <= end:
        with open('newfile.txt','w') as fileinput:
            while start <= end:
                result = makeList[start]
                fileinput.write(result)
                start += 1

def searchPFAM（fname）：
将open（fname，'rb'）作为f：
root=etree.parse（f）
对于root.xpath中的lcn（“/protein/match[@dbname='PFAM']/lcn”）：
尝试：
start=int（lcn.get（“start”））
end=int（lcn.get（“end”））
屈服开始，结束
除（TypeError、ValueError）外，如e：
通过
uniprotID='Q14591'
def createRef（）：
fileInput=open（uniprotID+'.txt'，r'）
readAA=fileInput.read（）
store_value=（readAA.partition（'\n'））
aaSequence=store_值[2]。替换（'\n'，''）
makeList=列表（aaSequence）
返回生成列表
makeList=createRef（）
对于开始，以searchPFAM（fname）结束：
打印开始、结束
如果start最常见的原因：您需要在脚本终止之前刷新输出文件

上面的片段：

with open('newfile.txt','w') as fileinput:
        while start <= end:
            result = makeList[start]
            fileinput.write(result)
            start += 1
fileinput.flush()

以open（'newfile.txt'，'w'）作为文件输入的
：
whilestart最常见的原因：在脚本终止之前，需要刷新输出文件

上面的片段：

with open('newfile.txt','w') as fileinput:
        while start <= end:
            result = makeList[start]
            fileinput.write(result)
            start += 1
fileinput.flush()

以open（'newfile.txt'，'w'）作为文件输入的
：
虽然开始只是猜测，但您可能想要：

with open('newfile.txt','w') as fileinput:
    for start, end in searchPFAM(fname):
        print start, end  
        if start <= end:
            while start <= end:
                result = makeList[start]
                fileinput.write(result)
                start += 1

以open（'newfile.txt'，'w'）作为文件输入的
：
对于开始，以searchPFAM（fname）结束：
打印开始、结束
如果开始只是猜测，但您可能想要：

with open('newfile.txt','w') as fileinput:
    for start, end in searchPFAM(fname):
        print start, end  
        if start <= end:
            while start <= end:
                result = makeList[start]
                fileinput.write(result)
                start += 1

以open（'newfile.txt'，'w'）作为文件输入的
：
对于开始，以searchPFAM（fname）结束：
打印开始、结束
如果start，则他将
与
一起使用，因此当该块被删除时，文件应自动关闭（并刷新）exited@Levon而且它确实
fileinput
奇怪地保留在作用域中，但实际上是一个关闭的fileobj，因此任何操作都失败。当我将flush（）放在say:ValueError:i/O operation on on closed中时，我收到了错误消息file@Levon好的@ChadD它确实保留在范围内，因为with子句没有将“new”var限制在with范围内，就像python
if
和
for
语法没有限制一样t@PhilCooper我真的不明白你什么意思？顺便说一句，我该如何修复这个问题？他正在使用
和
，所以当该块被删除时，文件应该自动关闭（并刷新）exited@Levon而且它确实
fileinput
奇怪地保留在作用域中，但实际上是一个关闭的fileobj，因此任何操作都失败。当我将flush（）放在say:ValueError:i/O operation on on closed中时，我收到了错误消息file@Levon好的@ChadD它确实保留在范围内，因为with子句没有将“new”var限制在with范围内，就像python
if
和
for
语法没有限制一样t@PhilCooper我真的不明白你什么意思？顺便说一句，我该怎么修？没问题。很乐意帮忙。有时候，这些简单的东西坐在那里盯着你的脸，它们很难被看到/跟踪。祝你好运，没问题。很乐意帮忙。有时候，这些简单的东西坐在那里盯着你的脸，它们很难被看到/跟踪。祝你好运