使用python和numpy解析文件中的坐标

我有一个从MD模拟软件包生成的坐标文件

格式如下:

（1.323232、1.22323、3.23123）

也可以按如下方式指定坐标的输出，不带逗号：

（1.323232 1.22323 3.23123）

如何用python解析数组中的这样一行。 具体来说，如何删除括号。

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在C语言中，使用scanf很容易做到这一点？

有两种明显的方法：使用或不使用regexp。因为您可能会得到300个regexp答案，所以让我们来演示如何在没有

我们要去掉paren，然后在空格或逗号后跟空格上拆分。另一种说法是：去掉paren，然后在空格上拆分，然后去掉可选的尾随逗号。例如：

line = line[1:-1] # strip the parens
bits = line.split() # split on whitespace
bits = [bit.rstrip(',') for bit in bits] # strip trailing commas
bits = map(float, bits) # convert to float

当然，您可以将这些内容合并到一行：

bits = [float(bit.rstrip(',')) for bit in line[1:-1].split()]

您可以这样做：

txt=['(1.323232, 1.22323, 3.23123)',
      '(1.32.3232, 1.22323, 3.23123)',
      '(1.323232 1.22323 3.23123)']

data=[]  
for i, s in enumerate(txt):
    st=s.strip().lstrip('(').rstrip(')')  
    if ',' in s:
        res=[e.strip() for e in st.split(',')]
    else:
        res=st.split()
    try:    
        res=map(float, res) 
    except ValueError:
        print 'Element {} "{}" is invalid'.format(i,s)    
        continue   

    data.append(res)   

print 'data:', data

印刷品：

Element 1 "(1.32.3232, 1.22323, 3.23123)" is invalid
data: [[1.323232, 1.22323, 3.23123], [1.323232, 1.22323, 3.23123]]

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我本来打算写一些类似于其他答案的东西，但是，为了完整起见，我将是正则表达式的家伙

import re
f = open('myfile', 'r')
r = re.compile(r'\-*\d+\.*\d+')
data =[]
for line in f:
    data.append(map(float, r.findall(line)))

将re更改为

r'\-*\d+\.*\d*'

还将捕获单个数字，例如（1、2、3）

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如何准确地用scanf解析带有可选逗号的线？每条线有多组坐标，还是只有一组？sscanf（线，（%lf，%lf），&vx[i]、&vy[i]、&vz[i]）；我的意思是不要为这件事感到抱歉confusion@Dimo你试过了吗？如果给它一行不带逗号的话，它将返回

1

，并保持

vy[i]

和

vz[i]

不变。我通常做一些类似

.strip（）.strip（'（）'）

的事情，而不是

[1:-1]

。感觉更安全了。@DSM：但是你仍然在处理无效的行而没有注释，可能更不正确，所以这种感觉只是一种错觉。如果你想验证输入，你需要一个显式的检查，可能只是

断言line.startswith（“（”）和line.endswith（“）”）

。我经常遇到尾随空格不一致的文件——有时我想知道是否有教程推荐

“\n”。加入（stuff）

——所以你不会让我相信，盲法

[1:-1]

比显式删除边界空白和括号要好。至少我知道我要删除哪些字符，而且这些知识——尽管我同意这是不合法的——避免了我经常遇到的一类bug。因此，从某种意义上说，可以感知的道并不是真正的道，这只是一种幻觉。@DSM：去掉尾随空格是一个独立的问题，与去掉括号是完全独立的。您可以执行

line.rstrip（）[1:-1]

。您可以执行

line.strip（“（）”）

。同时，您曾经用

strip（“（）”）

捕获过哪些您用

[1:-1]

无法捕获的bug？

import re
f = open('myfile', 'r')
r = re.compile(r'\-*\d+\.*\d*')
data =[]
for line in f:
    data.append(map(float, r.findall(line)))