Python 使用多个键将数据帧转换为字典

我目前正在使用一个数据帧，该数据帧由一列13个字母字符串（“13mer”）组成，并带有ID代码（“加入”）：

但是，我想创建一个字典，其中登录代码是键，值是与登录相关的13个mers，因此它看起来如下所示：

{'JO2176': ['IGY....', 'QLG...', 'ESS...', ...],
 'CYO21709': ['IGY...', 'TVL...',.............],
 ...}

我使用以下代码实现了这一点：

Accession_13mers = {}
for group in grouped:
    Accession_13mers[group[0]] = []
    for item in group[1].iteritems():
        Accession_13mers[group[0]].append(item[1])

但是，现在我想返回并迭代每个加入代码的键，并运行一个我定义为find_match_position（reference_sequence，13mer）的函数，该函数在引用序列中查找13 mer并返回其位置。然后我想把这个位置附加为13个MER的值，这将是关键

如果有人对我如何加快这一进程有任何想法，那将非常有帮助

谢谢

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Justin

通过解包，您可以更干净地遍历groupby：

d = {}
for key, s in df.groupby('Accession')['13mer']:
    d[key] = list(s)

这也使它更清楚，你应该把你的功能

。。。然而，我认为它可能更适合列举：

d2 = {}
for pos, val in enumerate(df['13mer']):
    d2[val] = pos

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我建议创建一个新的字典，它的值是另一个字典。基本上是嵌套字典

position_nmers = {}
for key in H1_Access_13mers:
    position_nmers[key] = {} # replicate key, val in new dictionary, as a dictionary
    for value in H1_Access_13mers[key]:
        position_nmers[key][value] = # do something

要反思字典并确保它是正确的：

print position_nmers