从子目录（bash、python）执行多个*.dat文件

我有以下资料：

我有一个包含子目录的目录，子目录中充满了文件。结构如下：

/周期表/{Element}\ulj\u dat/lj\u dat\u sim.dat

每个文件由两行（第一行是注释）和12列数据组成

我想得到的是遍历元素的所有文件夹（如Al、Cu等），打开创建的文件（例如

周期表

目录中名为“mergedlj.dat”），并将每个文件中的所有数据存储在父目录中的一个添加元素名中，作为合并文件的第一（或最后）列

最好的方法是忽略每个文件中的第一行，只保存第二行的数据

我在bash/shell脚本方面非常缺乏经验，但我认为这是最好的方法（Python也是可以接受的！）。不幸的是，我只有处理与脚本位于同一文件夹中的文件的经验，因此这对我来说是一些新的经验

下面是查找此文件的代码，但实际上它并不能满足我的需要：

find ../periodic_table/*_lj_dat/ -name lj_dat_sim.dat -print0 | while read -d $'\0' file; do 
    echo "Processing $file"
done

---

我们将非常感谢您的帮助

这里有一个Python解决方案

您可以使用获取匹配文件的列表，然后使用进行迭代

fileinput.filename（）

可用于获取当前正在处理的文件的名称，并可用于在新文件开始处理时确定当前元素，如

fileinput.isfirstline（）

所确定

将当前元素添加为合并文件的第一列。我假设输入文件中的字段分隔符是一个空格，但您可以通过更改下面的

'.join（）

来更改它

import re
import fileinput
from glob import glob

dir_prefix = '.'
glob_pattern = '{}/periodic_table/*_lj_dat/lj_dat_sim.dat'.format(dir_prefix)
element_pattern = re.compile(r'.*periodic_table/(.+)_lj_dat/lj_dat_sim.dat')

with open('mergedlj.dat', 'w') as outfile:
    element = ''
    for line in fileinput.input(glob(glob_pattern)):
        if fileinput.isfirstline():
            # extract the element name from the file name
            element = element_pattern.match(fileinput.filename()).groups()[0]
        else:
            print(' '.join([element, line]), end='', file=outfile)

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您可以使用

os.path.join（）

来构造glob和element regex模式，但为了避免混淆答案，我省略了上面的内容。

看看python的

os

模块。它可以很好地引导您浏览目录树。是的，我对python的实现有一个想法，但我认为bash应该很简单（更短）。。。无论如何，谢谢，如果我用Python来做，我会把它贴在这里。谢谢你的回答！它起作用了，但我改变了以下内容：

glob_pattern='{}/*\u lj_dat/lj_dat_sim.dat'.format（dir_prefix）

和

element_pattern=re.compile（r'（.+）\u lj_dat/lj_dat_sim.dat'

，因为只要我把代码文件放在“周期表”目录中，代码就会循环。再次感谢！