Python 运行Stringtie prepDE.py后，您能帮助我解决出现的错误吗？

当我运行prepDE.py作业退出时，出现以下错误。我正在使用StringTie/2.1.4和Python/2.7.18。 下面是我正在运行的命令（在ADA集群内）

回溯（最近一次调用上次）：文件 “/sw/eb/software/StringTie/2.1.4-GCC-9.3.0/bin/prepDE.py”，第58行，in samples=[（i，glob.iglob（os.path.join（opts.input，i，“*.gtf”））.next（）） 对于下一步中的i（os.walk（opts.input））如果重新搜索（opts.pattern，i）] 停止迭代

我有一个目录结构如下

在这方面你能帮我吗？

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提前感谢。

这是一个基于错误和

-i输入，--INPUT=INPUT，--in=INPUT
–一个包含所有样本子目录的文件夹，或一个文本文件，每行带有样本ID及其GTF文件路径[默认值：.]

尝试使用以下命令调用脚本：

prepDE.py -i ballgown

---

因为数据子文件夹位于

文件夹中。
还共享您正在使用的命令行。异常闻起来好像应用程序找不到预期的文件。只是更新了帖子。我是按照这里的指示办事的，真是妙不可言！非常感谢你！
├── ballgown
│   ├── PVX_2d_1
│   │   ├── e2t.ctab
│   │   ├── e_data.ctab
│   │   ├── i2t.ctab
│   │   ├── i_data.ctab
│   │   ├── PVX_2d_1.gtf
│   │   └── t_data.ctab
│   ├── PVX_2d_2
│   │   ├── e2t.ctab
│   │   ├── e_data.ctab
│   │   ├── i2t.ctab
│   │   ├── i_data.ctab
│   │   ├── PVX_2d_2.gtf
│   │   └── t_data.ctab
│   ├── PVX_2d_3
│   │   ├── e2t.ctab
│   │   ├── e_data.ctab
│   │   ├── i2t.ctab
│   │   ├── i_data.ctab
│   │   ├── PVX_2d_3.gtf
│   │   └── t_data.ctab

prepDE.py -i ballgown