python-scipy-spearman关联

我试图从dataframe（df）中获取列名，并将它们与spearmanr相关函数生成的结果数组相关联。我需要将列名（a-j）与相关值（spearman）和p值（spearman_pvalue）关联起来。是否有一种直观的方法来执行此任务

from scipy.stats import pearsonr,spearmanr
import numpy as np
import pandas as pd

df=pd.DataFrame(np.random.randint(0,100,size= (100,10)),columns=list('abcdefghij'))

def binary(row):
    if row>=50:
        return 1
    else:
        return 0
df['target']=df.a.apply(binary)

spearman,spearman_pvalue=spearmanr(df.drop(['target'],axis=1),df.target)
print(spearman)
print(spearman_pvalue)

看来你需要：

from scipy.stats import spearmanr

df=pd.DataFrame(np.random.randint(0,100,size= (100,10)),columns=list('abcdefghij'))
#print (df)

#faster for binary df
df['target'] = (df['a'] >= 50).astype(int)
#print (df)

spearman,spearman_pvalue=spearmanr(df.drop(['target'],axis=1),df.target)

df1 = pd.DataFrame(spearman.reshape(-1, 11), columns=df.columns)
#print (df1)

df2 = pd.DataFrame(spearman_pvalue.reshape(-1, 11), columns=df.columns)
#print (df2)

### Kyle, we can assign the index back to the column names for the total matrix:
df2=df2.set_index(df.columns)
df1=df1.set_index(df.columns)

或：

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嗨，耶兹雷尔，我试着用df['target']实现这一点，但在重塑时失败了。请您调整代码，使spearman如下：spearman，spearman\u pvalue=spearman（df.drop（['target']，axis=1），df.target）。我需要这个来将统计数据与spearman关联的二进制目标关联起来，否则我会使用pearson（离散vs连续）。哎呀，我忘记了

target

列。现在应该很好用了

df1 = pd.DataFrame(spearman.reshape(-1, 11), 
                  columns=df.columns, 
                  index=df.columns)
df2 = pd.DataFrame(spearman_pvalue.reshape(-1, 11), 
                   columns=df.columns, 
                   index=df.columns)