Python 生成随机数据

我试图使用以下脚本以3-mer形式（如AEF）为“ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY”生成随机数据，但在输出中我得到了许多类似的3-mer。请你告诉我如何做，不要得到类似的结果或删除相同的3-mer

提前感谢,， 伯克

只是

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应该没问题

要删除相同的项目，只需将其设置为一组：

print set(random_AA_seq(a))

要获得所有可能的排列，您还可以使用itertools

from itertools import permutations

length = 3
print permutations('ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY', length)

。。。然后随机挑选你的3人。

根据评论：

alphabet = "ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY"
all_trimers = map("".join, itertools.product(* [alphabet] * 3))
a_few_distinct_trimers = random.sample(all_trimers, 42)

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更新的答案，以下脚本将返回所需长度的3个字符的列表。列表中每3个字符将出现一次：

import random

def random_3mers(length):
    seqs = set()

    while len(seqs) < length:
        seqs.add("".join(random.sample("ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY", 3)))

    lseqs = list(seqs)
    random.shuffle(lseqs)
    return lseqs

for three_mer in random_3mers(10):
    print three_mer

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与ABC+ABC中的类似或与AAA中的类似？与ABC+ABC中的类似。我需要AAA，但不需要（AAA+AAA）和

列表（itertools.compositions（…，3））

如果OP不喜欢“AAA”trimers@qarma：

itertools.permutations

已经排除了同一结果集中的多个值：）是的，但我需要3-mer项（如AAA、ABC和…）没问题，然后只传递3作为长度。再次，我面临着许多重复的3-mer，比如ACF、ACF、ACF-MNP、MNP和…好的，我已经重做了脚本，希望这将更接近你需要的。我如何才能只在一列中获得3-mer项目，而不使用逗号？我需要AAA，但不需要AAA+AAA

alphabet = "ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY"
all_trimers = map("".join, itertools.product(* [alphabet] * 3))
a_few_distinct_trimers = random.sample(all_trimers, 42)

import random

def random_3mers(length):
    seqs = set()

    while len(seqs) < length:
        seqs.add("".join(random.sample("ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY", 3)))

    lseqs = list(seqs)
    random.shuffle(lseqs)
    return lseqs

for three_mer in random_3mers(10):
    print three_mer

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