Python中hdf5库与ctypes的结合使用

我想使用

hdf5

库直接从

Python

与

ctypes

一起使用。我知道

h5py

和

PyTables

做得很好。我想这样做的原因是：我需要使用

hdf5

文件和

Python

解释器，在那里我无法安装任何软件包

我正在寻找一个例子，创建一个文件，并写一个清单的双重

到目前为止，我已经写了

from ctypes import *
hdf5Lib=r'/usr/local/lib/libhdf5.dylib'
lib=cdll.LoadLibrary(hdf5Lib)
major = c_uint()
minor = c_uint()
release = c_uint()
lib.H5get_libversion(byref(major), byref(minor), byref(release))
H5Fopen=lib.H5Fopen
...

---

我不知道怎么打电话给Fopen。我应该使用

H5Fopen.argtypes

？任何建议都可以打开hdf5文件，创建一个双精度数据集，写入数据并关闭文件。

您不需要定义argtypes，因为

H5Fopen

似乎不接受参数。只需像常规函数一样调用：

herr_t = lib.H5Fopen()

编辑：对于带有参数的版本，请尝试：

lib.H5Fopen.restype = c_int
lib.H5Fopen.argtypes = (c_char_p, c_uint, c_int)
herr_t = lib.H5open(name, flags, fapl_id)

只需为名称传递一个字符串，为其他两个传递int。

我（还）没有做过任何Hdf5编程，但仔细看，我看到一些事情要告诉你

将传递给H5Fopen的参数：名称是要打开的文件名。标志将为H5F_ACC_RDWR（1）或H5F_ACC_RDONLY（0）。这些旗帜相互排斥；不要把他们放在一起。第二个int是文件访问属性列表的标识符。对于基本情况，可以将其设置为H5P_默认值（0）

不过，以下是文档中的重要内容：

请注意，如果H5Fopen不存在，它不会创建文件；请参阅H5Fcreate.

根据你的描述，你不想使用H5Fopen。您想使用H5Fcreate

对于H5Fcreate，这是签名

hid_t H5Fcreate( const char *name, unsigned flags, hid_t fcpl_id, hid_t fapl_id )

Name是文件名。fcpl_id和fapl_id都可以是H5P_默认值，即0。在这种情况下，您的标志是H5F_ACC_TRUNC（2）以覆盖现有文件，或H5F_ACC_EXCL（4）以在尝试创建现有文件时导致错误

我假设你有权找到我列出的常量值，但如果你没有，你可以像我一样，在

---

这些信息，再加上@101关于如何调用函数的示例，应该足以让您创建初始文件。

我遵循了给出的建议，并编写了一个小型C程序来发现不同宏的价值

#include "hdf5.h"
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main (void)
{
    printf("H5F_ACC_TRUNC  = %u\n",H5F_ACC_TRUNC);
    printf("H5P_DEFAULT    = %u\n",H5P_DEFAULT);
    printf("H5T_STD_I32LE  = %u\n",H5T_STD_I32LE);
    printf("H5T_STD_I32BE  = %i\n",H5T_STD_I32BE);
    printf("H5T_NATIVE_INT = %u\n",H5T_NATIVE_INT);
    printf("H5S_ALL        = %u\n",H5S_ALL);
    return 0;
}

---

函数

H5Fopen

接受参数：它的原型是

hid\u t H5Fopen（const char*name，unsigned flags，hid\u t fapl\u id）我需要帮助才能使用此函数的三个参数我需要使用带有Python解释器的hdf5文件，在那里我无法安装任何软件包。如果允许在文本编辑器中键入文本并保存它，为什么不能将相关的python代码复制粘贴到工作目录？对我来说，这似乎是一个简单得多的解决方案。
H5F_ACC_TRUNC  = 2
H5P_DEFAULT    = 0
H5T_STD_I32LE  = 50331712
H5T_STD_I32BE  = 50331713
H5T_NATIVE_INT = 50331660
H5S_ALL        = 0