在R/Python中为边节点三角形邻接矩阵创建联合聚类

我有下面的边（行）节点（cols）三角形邻接矩阵，其中如果边属于三角形，则每个条目中都有一个。我想在这个矩阵上进行联合聚类（但正如你看到的，它不是一个传统的伴随矩阵）。如果R中已经有一些共聚类函数，那会怎么样？我知道R在

blockcluster

中包含了cocluster函数，但是找不到一个很好的例子来使用它。Python/R代码/包应该适合我

这是图表

library(igraph)
set.seed(1)
g <- erdos.renyi.game(15, .6)

73 x 15 sparse Matrix of class "dgCMatrix"

 [1,] 1 1 . . . . . . . . . . . . .
 [2,] . 1 1 . . . . . . . . . . . .
 [3,] 1 . . . 1 . . . . . . . . . .
 [4,] . 1 . . 1 . . . . . . . . . .
 [5,] . . 1 . 1 . . . . . . . . . .
 [6,] . . . 1 1 . . . . . . . . . .
 [7,] 1 . . . . 1 . . . . . . . . .
 [8,] . . . 1 . 1 . . . . . . . . .
 [9,] 1 . . . . . 1 . . . . . . . .
[10,] . 1 . . . . 1 . . . . . . . .
[11,] . . 1 . . . 1 . . . . . . . .
[12,] . . . . . 1 1 . . . . . . . .
[13,] 1 . . . . . . 1 . . . . . . .
[14,] . . 1 . . . . 1 . . . . . . .
[15,] . . . 1 . . . 1 . . . . . . .
[16,] . . . . 1 . . 1 . . . . . . .
[17,] . . . . . 1 . 1 . . . . . . .
[18,] . . . . . . 1 1 . . . . . . .
[19,] 1 . . . . . . . 1 . . . . . .
[20,] . . . 1 . . . . 1 . . . . . .
[21,] . . . . 1 . . . 1 . . . . . .
[22,] . . . . . 1 . . 1 . . . . . .
[23,] . . . . . . 1 . 1 . . . . . .
[24,] . . . . . . . 1 1 . . . . . .
[25,] 1 . . . . . . . . 1 . . . . .
[26,] . 1 . . . . . . . 1 . . . . .
[27,] . . 1 . . . . . . 1 . . . . .
[28,] . . . . 1 . . . . 1 . . . . .
[29,] . . . . . . 1 . . 1 . . . . .
[30,] . . . . . . . 1 . 1 . . . . .
[31,] . . . . . . . . 1 1 . . . . .
[32,] . . 1 . . . . . . . 1 . . . .
[33,] . . . 1 . . . . . . 1 . . . .
[34,] . . . . 1 . . . . . 1 . . . .
[35,] . . . . . 1 . . . . 1 . . . .
[36,] . . . . . . . 1 . . 1 . . . .
[37,] . . . . . . . . 1 . 1 . . . .
[38,] . 1 . . . . . . . . . 1 . . .
[39,] . . 1 . . . . . . . . 1 . . .
[40,] . . . 1 . . . . . . . 1 . . .
[41,] . . . . 1 . . . . . . 1 . . .
[42,] . . . . . 1 . . . . . 1 . . .
[43,] . . . . . . 1 . . . . 1 . . .
[44,] . . . . . . . 1 . . . 1 . . .
[45,] . . . . . . . . 1 . . 1 . . .
[46,] . . . . . . . . . . 1 1 . . .
[47,] 1 . . . . . . . . . . . 1 . .
[48,] . 1 . . . . . . . . . . 1 . .
[49,] . . 1 . . . . . . . . . 1 . .
[50,] . . . 1 . . . . . . . . 1 . .
[51,] . . . . . 1 . . . . . . 1 . .
[52,] . . . . . . 1 . . . . . 1 . .
[53,] . . . . . . . . 1 . . . 1 . .
[54,] . . . . . . . . . 1 . . 1 . .
[55,] . . . . . . . . . . 1 . 1 . .
[56,] 1 . . . . . . . . . . . . 1 .
[57,] . 1 . . . . . . . . . . . 1 .
[58,] . . 1 . . . . . . . . . . 1 .
[59,] . . . 1 . . . . . . . . . 1 .
[60,] . . . . . 1 . . . . . . . 1 .
[61,] . . . . . . . 1 . . . . . 1 .
[62,] . . . . . . . . . 1 . . . 1 .
[63,] . . . . . . . . . . 1 . . 1 .
[64,] . . . . . . . . . . . . 1 1 .
[65,] . 1 . . . . . . . . . . . . 1
[66,] . . . 1 . . . . . . . . . . 1
[67,] . . . . 1 . . . . . . . . . 1
[68,] . . . . . 1 . . . . . . . . 1
[69,] . . . . . . 1 . . . . . . . 1
[70,] . . . . . . . 1 . . . . . . 1
[71,] . . . . . . . . . . 1 . . . 1
[72,] . . . . . . . . . . . . 1 . 1
[73,] . . . . . . . . . . . . . 1 1

库（igraph）
种子（1）
gscikit学习中存在双聚类（与共聚类相同）




我不知道你问题的R部分
library(igraph)

library(blockcluster)

set.seed(1)
g <- erdos.renyi.game(15, .6)
m <- get.adjacency(g)
m <- as.matrix(m)

cc <- cocluster(m, datatype="binary", nbcocluster=c(3,3))

图书馆（区块集群）
种子（1）
g我不认为
igraph
中包含
coclustering
功能。@GaborCsardi我在这个链接中提到了
coclustering
，如果
igraph
有
coclustering
功能，那就太好了。请提供更多关于
coclustering
在矩阵中失败的原因的信息（即失败时打印什么？）。我刚刚尝试了
共聚类（as.matrix（m），datatype=“binary”，nbcocluster=c（3,3））
其中
m
是一个稀疏矩阵，对我来说效果非常好。请注意，您需要
as.matrix（m）
，因为
cocluster
似乎只对密集矩阵有效。