如何在Python中检查.h5文件

如何查看给定的.h5文件在Python中包含哪些变量、数据集等

我可以通过运行此命令读取文件

import h5py
f = h5py.File(filename, 'r')

我现在如何查看.h5文件中包含哪些变量

运行

f.keys（）

KeysView(<HDF5 file filename (mode r)>)

KeysView（）

在Matlab中，我只调用h5disp（filename），但想知道如何在Python中实现它
您尝试过吗

print(list(f.keys()))

这将为您提供hdf5文件中的所有组。如果f是一个组，则可以对数据集执行相同的操作。
可能有些过分，但我有此功能，可能对某些人有用：

from __future__ import print_function

def scan_hdf5(path, recursive=True, tab_step=2):
    def scan_node(g, tabs=0):
        print(' ' * tabs, g.name)
        for k, v in g.items():
            if isinstance(v, h5.Dataset):
                print(' ' * tabs + ' ' * tab_step + ' -', v.name)
            elif isinstance(v, h5.Group) and recursive:
                scan_node(v, tabs=tabs + tab_step)
    with h5.File(path, 'r') as f:
        scan_node(f)

和简单的输入：

>>> scan_hdf5('/tmp/dummy.h5')
/
   - /d1
   /g1
     - /g1/d2
     - /g1/d3
   /g2
     - /g2/d4
     /g2/g3
       - /g2/g3/d5

或以更有用的形式返回元素的替代版本：

有回报：

>>> scan_hdf5_2('/tmp/dummy.h5')
[u'/d1',
 (u'/g1', [u'/g1/d2', u'/g1/d3']),
 (u'/g2', [u'/g2/d4', (u'/g2/g3', [u'/g2/g3/d5'])])]

我在试图找出一种方法来显示h5文件中的每个节点时遇到了这个问题，以便能够仅提取具有相应数据集的想要的节点

我认为这是一个非常简单但容易理解的（对我来说）片段：

因此，我将在GUI应用程序中使用它，我将只启用选择“dataset”标记的项。
这是必需的，因为在Python3中，f.keys（）返回和迭代器，应该显式展开为列表。它输出“['#refs#'、“var1”、“var2”、“var3”、“var4”]“refs”是什么意思？我建议你看看里面有什么。据我们判断，它是hdf5文件中的一个组，但如果不提供关于它是如何创建的（您可能没有）更多信息，则很难判断。如果您希望获得用于调试的键列表，也可以这样做：
keys=[key for key in f.keys（）]
你在使用python3吗？是的………那么@Astrom建议的解决方案应该对python3有所帮助，python3是一个
字典。keys（）
提供了一个“KeyView”，它必须用
列表展开（或者可以直接在迭代中使用）。
>>> scan_hdf5_2('/tmp/dummy.h5')
[u'/d1',
 (u'/g1', [u'/g1/d2', u'/g1/d3']),
 (u'/g2', [u'/g2/d4', (u'/g2/g3', [u'/g2/g3/d5'])])]

h5 = h5py.File(filename, 'r')
def hierarchy(d):
    for item in d:
        if ' 0 member' in str(d[item]):
            print(d[item].name, ['empty group'])
        if isinstance(d[item], h5py.Group):
            hierarchy(d[item])
        else: #Dataset
            print(d[item].name, ['dataset'])
hierarchy(h5)