anaconda（libxml2.2.dylib）在OSX 10.10.5中导入python igraph时出错

我按照本线程中的说明安装了anaconda的python igraph库，因此成功安装了C核心库和python包。但是，当我尝试在python中导入igraph库时，出现了以下错误

>>> import igraph
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/Users/user/anaconda/lib/python2.7/site-packages/igraph/__init__.py", line 34, in <module>
    from igraph._igraph import *
ImportError: dlopen(/Users/user/anaconda/lib/python2.7/site-packages/igraph/_igraph.so, 2): Library not loaded: libxml2.2.dylib
  Referenced from: /Users/user/anaconda/lib/python2.7/site-packages/igraph/_igraph.so
  Reason: Incompatible library version: _igraph.so requires version 12.0.0 or later, but libxml2.2.dylib provides version 10.0.0

导入igraph 回溯（最近一次呼叫最后一次）： 文件“”，第1行，在 文件“/Users/user/anaconda/lib/python2.7/site packages/igraph/_init__.py”，第34行，在 从igraph.\u igraph导入* 导入错误：dlopen（/Users/user/anaconda/lib/python2.7/site-packages/igraph//u igraph.so，2）：未加载库：libxml2.2.dylib 引用自：/Users/user/anaconda/lib/python2.7/site-packages/igraph//u igraph.so 原因：库版本不兼容：_igraph.so需要版本12.0.0或更高版本，但libxml2.2.dylib提供版本10.0.0

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寻找类似的线程，我在这里发现了类似的问题。然而，如何解决这个问题，目前还没有一个明确的方法。有人知道怎么修吗？提前感谢。

Anaconda Python很奇怪-它附带了自己版本的

libxml2

，当您运行

pip-install-Python-igraph

时，igraph可能与之链接。但是，当您尝试导入igraph时，链接器会找到系统范围的

libxml2

，它的ABI版本较低，因此您会看到错误消息

解决方法是确保在编译阶段，编译器不会使用Anaconda Python的

libxml2

setup.py实际上包含了这个解决方法-它尝试检测您在OS X上针对Anaconda Python编译igraph时的情况，然后稍微调整环境以确保链接器选择正确版本的

libxml2

。但是，只有当您的机器上没有安装igraph的C核心时，才能启用此变通方法-安装程序将下载C核心，调整环境以使用Anaconda Python，然后在一个步骤中将C核心和Python接口编译在一起

因此，解决方案可能是以下之一：

将Anaconda Python的libxml2移开（或者暂时从Anaconda Python的发行版中重命名

xml2 config

），然后从自制中编译并安装C内核。（为了安全起见，请使用

brew取消igraph

，

brew卸载igraph

，

brew安装igraph

）。然后可以运行

pip安装pythonigraph

完全删除自制的igraph，只需运行

pip install python igraph

——它将下载C内核，执行必要的调整，然后编译所有内容

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我遇到了完全相同的问题，安装/force-linking

libxml2

对我有效：

brew install libxml2
brew link --force libxml2

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其他人也报告了相同的解决方案，而且似乎有效。

请参见我对另一个（但相关）问题的回答中的第1点：Hi@Tamás。我找到了所有出现的

libxml2*.dylib

，它们都在

usr/local/ceral/libxml2/2.9.2/lib//code>，
usr/lib//code>，
anaconda/lib
，
opt/local/lib
和
anaconda/pkgs/libxml2-2.9.0-1/lib>中，分别有12.2.0.10.9.0、12.2.0.0、12.2.0.0.0、12.2.0.0和12.0.0版本。根据您上一篇文章中的建议，我是否应该更改
usr/lib/
中的文件名，即10.9.0版本的文件名，并保留其他文件的原样？谢谢。不，恰恰相反-试着去掉那些版本为
12.x
，重新编译，然后重新命名。原因是，当您尝试导入igraph时，链接器显然会找到版本为10.9.0的链接器，因此如果您重命名版本为10.9.0的链接器，然后重新编译igraph，它仍将使用12.0.0进行编译。（另外，ABI 10.9.0版的
libxml2
似乎是系统范围的libxml2，因此重命名它是危险的）。我尝试了您之前所说的，但它仍然抱怨导入igraph，它说
原因：库版本不兼容：_igraph.so需要12.0.0或更高版本，但libxml2.2.dylib提供了10.0.0版本。
我想知道它是否与执行安装的位置有关。我正在使用brew编译和安装核心
brew安装igraph
，然后
pip安装python igraph
。但核心似乎在
/usr/local/cillar/igraph/0.7.1
中，python包在
/Users/user/anaconda/lib/python2.7/site packages/igraph/
中。有什么建议吗？我在下面添加了一个正确的答案-让我们继续讨论。Hi@Tamás。我尝试了两种建议的解决方案，但仍然得到了
原因：库版本不兼容：_igraph.so需要12.0.0或更高版本，但libxml2.2.dylib提供了10.0.0版本。
特别是，对于我做的第一个解决方案：1。重命名Anaconda文件夹中的
libxml2.2dylib
文件，即
Anaconda/lib
和
Anaconda/pkgs/libxml2-2.9.0-1/lib
；2. <代码>brew取消igraph的链接
；3. <代码>brew卸载igraph
；4. <代码>brew安装igraph

；5.

pip安装pythonigraph

；6.重新命名我在1中更改的

libxml2.2dylib

文件。对于第二个解决方案，1。重命名Anaconda文件夹中的

libxml2.2dylib

文件，即

Anaconda/lib

和

Anaconda/pkgs/libxml2-2.9.0-1/lib

；2. <代码>brew取消igraph的链接；3. <代码>brew卸载igraph；4.

pip安装pythonigraph

；5.重新命名我在1中更改的

libxml2.2dylib

文件。但还是一样的错误。我错过什么了吗？谢谢。嗨，塔玛斯。似乎我有多个版本的

xml2 config

文件。它们位于

anaconda/pkgs/libxml2-2.9.2-0/bin

，

a中