Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/2/python/299.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
Python中的类常量字典_Python_Class_Dictionary - Fatal编程技术网

Python中的类常量字典

Python中的类常量字典,python,class,dictionary,Python,Class,Dictionary,我正在构建一个具有类变量字典的模块: class CodonUsageTable: CODON_DICT={'TTT': 0, 'TTC': 0, 'TTA': 0, 'TTG': 0, 'CTT': 0, 'CTC': 0, 'CTA': 0, 'CTG': 0, 'ATT': 0, 'ATC': 0, 'ATA': 0, 'ATG': 0, 'GTT': 0, 'GTC': 0, 'GTA': 0, 'GTG': 0, 'TAT

我正在构建一个具有类变量字典的模块:

class CodonUsageTable:
        CODON_DICT={'TTT': 0, 'TTC': 0, 'TTA': 0, 'TTG': 0, 'CTT': 0,
        'CTC': 0, 'CTA': 0, 'CTG': 0, 'ATT': 0, 'ATC': 0,
        'ATA': 0, 'ATG': 0, 'GTT': 0, 'GTC': 0, 'GTA': 0,
        'GTG': 0, 'TAT': 0, 'TAC': 0, 'TAA': 0, 'TAG': 0,
        'CAT': 0, 'CAC': 0, 'CAA': 0, 'CAG': 0, 'AAT': 0,
        'AAC': 0, 'AAA': 0, 'AAG': 0, 'GAT': 0, 'GAC': 0,
        'GAA': 0, 'GAG': 0, 'TCT': 0, 'TCC': 0, 'TCA': 0,
        'TCG': 0, 'CCT': 0, 'CCC': 0, 'CCA': 0, 'CCG': 0,
        'ACT': 0, 'ACC': 0, 'ACA': 0, 'ACG': 0, 'GCT': 0,
        'GCC': 0, 'GCA': 0, 'GCG': 0, 'TGT': 0, 'TGC': 0,
        'TGA': 0, 'TGG': 0, 'CGT': 0, 'CGC': 0, 'CGA': 0,
        'CGG': 0, 'AGT': 0, 'AGC': 0, 'AGA': 0, 'AGG': 0,

#Other code

        def __init__(self,seqobj):
                '''Creates codon table for a given Bio.seq object.i
                The only argument is Bio.Seq object with DNA
                Currently assumes seq to be DNA, RNA support to be added later'''
                dnaseq=str(seqobj)
                self.usage_table=CodonUsageTable.CODON_DICT.deepcopy()#instance of table
最后一行必须复制一个类字典来存储实例数据,但它会抛出

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "./codon_usage.py", line 47, in __init__
    self.usage_table=CodonUsageTable.CODON_DICT.deepcopy()#instance of codon usage table
NameError: global name 'CODON_DICT' is not defined

这些症状暗示着故事是这样的:

  • 您编写并保存了该文件
  • 您运行了pythonshell
  • 你发现,
    CODON\u DICT
    不能像那样访问,并修复了它
  • 您在同一个Python shell中再次尝试了该调用,但出现了该错误
  • 这是因为Python仍在使用旧版本的模块,该模块在导入期间加载。虽然它显示了新文件中的行,但因为它在内存中只有带元数据的字节码,并且在发生错误时必须引用磁盘。如果要在不重新启动shell的情况下选择最新更改,请运行:

    >>> reload(codon_usage)
    
    然后再试一次


    (旁注:
    dict
    没有方法
    deepcopy
    ,该函数来自模块
    copy
    dict.copy
    在这里就足够了).CODON\u DICT/CODON\u DICT/g类本身内部让我猜猜:您是从python shell运行它并并行编辑文件吗?您的字典结构正确吗?在我看来,有一个结束括号丢失了。此外,当您从命令行访问密码时,在末尾还有一个额外的右括号。看起来不像字典。@sid,在复制粘贴时把它弄糟了。
    >>> reload(codon_usage)