Python 使用igraph读取“ncol”格式，同时保留标签

我需要一种自动读取“ncol”格式边缘列表的方法，同时保留标签

例如：

给定一个小图。edgelist：

0 1 0.47
0 2 0.67
0 3 0.98
0 4 0.12
0 5 0.82
0 10 0.34
1 2 0.94
1 3 0.05
1 4 0.22
2 3 0.24
2 4 0.36
3 4 0.69
5 6 0.97
5 8 0.44
5 7 0.43
5 9 0.37
6 7 0.83
6 8 0.49
6 9 0.55
7 8 0.39
7 9 0.73
8 9 0.68
10 11 0.22
10 14 0.59
11 12 0.40
12 13 0.78
13 14 0.81

图表：

我尝试：

import igraph
g = igraph.read("smallgraph.edgelist", format="ncol", directed=False, names=True)

但此函数不保留标签

此函数生成的输出：

for edge in g.es():
    print edge.tuple[0], edge.tuple[1], edge["weight"]

0 1 0.47
0 2 0.67
0 3 0.98
0 4 0.12
0 5 0.82
0 6 0.34 -> e.g.: Considering the original labels here should be '0 10 0.34'
1 2 0.94
1 3 0.05
1 4 0.22
2 3 0.24
2 4 0.36
3 4 0.69
5 7 0.97
5 8 0.44
5 9 0.43
5 10 0.37
6 11 0.22
6 12 0.59
7 8 0.49
7 9 0.83
7 10 0.55
8 9 0.39
8 10 0.68
9 10 0.73
11 13 0.4
12 14 0.81
13 14 0.78

输出：

输入文件small-graph.edgelist的标签不保留

我认为这样的方法可以奏效：

g = igraph.Graph()
g.add_vertices(15)
g = igraph.read("input/small-graph.edgelist", format="ncol", directed=False, names=True)

但这不管用，我也不知道怎么做。

---

有人知道如何保留原始标签吗？

原始标签被保留，但它们存储在“名称顶点”属性中。像往常一样在阅读图表后尝试以下操作：

names = g.vs["name"]
for edge in g.es:
    print names[edge.tuple[0]], names[edge.tuple[1]], edge["weight"]

更新：如果您完全确定您的文件只包含从零开始的连续数字ID，即如果您有n个顶点，则您的ID从零到n-1，则可以执行以下操作：

edges, weights = [], []
for line in open("input_file.txt"):
    u, v, weight = line.split()
    edges.append((int(u), int(v)))
    weights.append(float(weight))
g = Graph(edges, edge_attrs={"weight": weights})

---

原始标签将保留，但它们存储在“名称顶点”属性中。像往常一样在阅读图表后尝试以下操作：

names = g.vs["name"]
for edge in g.es:
    print names[edge.tuple[0]], names[edge.tuple[1]], edge["weight"]

更新：如果您完全确定您的文件只包含从零开始的连续数字ID，即如果您有n个顶点，则您的ID从零到n-1，则可以执行以下操作：

edges, weights = [], []
for line in open("input_file.txt"):
    u, v, weight = line.split()
    edges.append((int(u), int(v)))
    weights.append(float(weight))
g = Graph(edges, edge_attrs={"weight": weights})

---

在更新了Tamás的答案的基础上，对文件仅包含从零开始的连续数字ID的情况进行了一些改进。这适用于有向图并处理某些情况，例如从0到任何其他顶点可能没有边：

read_edges(num_vertices,input_graph):
   g = Graph(directed=True)
   g.add_vertices(list(range(0,num_vertices)))
   for line in open(input_graph):
      u, v= line.split()
      g.add_edge(int(u), int(v))
   return g

---

在更新了Tamás的答案的基础上，对文件仅包含从零开始的连续数字ID的情况进行了一些改进。这适用于有向图并处理某些情况，例如从0到任何其他顶点可能没有边：

read_edges(num_vertices,input_graph):
   g = Graph(directed=True)
   g.add_vertices(list(range(0,num_vertices)))
   for line in open(input_graph):
      u, v= line.split()
      g.add_edge(int(u), int(v))
   return g

---

谢谢但是没有办法保存身份证？例如：init g=igraph.Graph15，下一个读取文件边缘列表！！谢谢但是没有办法保存身份证？例如：init g=igraph.Graph15，下一个读取文件边缘列表！！